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Enregistrement W3021518689 · doi:10.1002/jcp.29770

Histone H4 variant, H4G, drives ribosomal RNA transcription and breast cancer cell proliferation by loosening nucleolar chromatin structure

2020· article· en· W3021518689 sur OpenAlexafffund
Matthew Yu Hin Pang, Xulun Sun, Juan Ausió, Toyotaka Ishibashi

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchResearch Grants Council, University Grants Committee
Mots-clésNucleolusChromatinRibosome biogenesisNucleophosminCell biologyNucleosomeBiologyTranscription (linguistics)HistoneRNACancer researchMolecular biologyRibosomeGeneticsDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hominidae-specific histone variant H4G is expressed in breast cancer patients in a stage-dependent manner. H4G localizes primarily in the nucleoli via its interaction with nucleophosmin (NPM1). H4G is involved in rDNA transcription and ribosome biogenesis, which facilitates breast cancer cell proliferation. However, the molecular mechanism underlying this process remains unknown. Here, we show that H4G is not stably incorporated into nucleolar chromatin, even with the chaperoning assistance of NPM1. H4G likely form transient nucleosome-like-structure that undergoes rapid dissociation. In addition, the nucleolar chromatin in H4GKO cells is more compact than WT cells. Altogether, our results suggest that H4G relaxes the nucleolar chromatin and enhances rRNA transcription by forming destabilized nucleosome in breast cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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