Chromosomal alterations in oligodendroglial tumors over multiple surgeries: Is progression associated with change in 1p/19q status?
Notice bibliographique
Résumé
10577 Background: There is morphologic and genotypic heterogeneity of oligodendroglial neoplasms. Tumors with loss of heterozygosity (LOH) of 1p and/or 19q are associated with increased chemo-sensitivity and survival. Despite treatment, rates of recurrence and malignant transformation are high. The pathogenesis of treatment-resistance is unknown. We aim to determine if tumour progression is associated with a proliferation of clonagens with retention of heterozygosity (ROH) of 1p, or if progressing tumours remain 1p/19q LOH. Methods: Between 1/1/2001 and 7/31/2006, 24 patients with oligodendroglial neoplasms, and possessing serial biopsies taken at diagnosis and at progression, were identified. Using PCR amplification of multiple microsatellite markers, a total of 53 tumour specimens were available for LOH analysis of 1p and 19q; 40 were also tested for 9p and 10q. Results: At diagnosis, the median age was 34 (24–66) years and 14 were male. Using the WHO criteria, 19 tumors were Grade II oligodendrogliomas or oligoastrocytomas, and 5 were high grade. The most common genomic status was 19q LOH (88%); 54% had 1p LOH. Of the 13 primary biopsies with 1p LOH, 11 had 19q LOH, 1 had 19q ROH, and 1 was 19q non-informative. A further 2 primaries were mixed 1p LOH/ROH, and 9 were 1p ROH. At progression, 10 of 11 patients with 1p/19q LOH had persistent co-deletion. The patient with 1p LOH and 19q ROH at diagnosis, had 1p/19q LOH at progression. Of the mixed 1p primaries, 1 was 1p ROH, and the other remained mixed LOH/ROH at progression. 8 of 9 primaries with 1p ROH remained 1p ROH. There was also little heterogeneity of 9p and 10q between primary and progressive tumours. Using Kaplain-Meier analysis, mean overall survival (OS) for the group was 102 (95% CI: 77–127) months. Mean progression-free survival was 52 (95% CI: 33–72) months. OS was not statistically significant between patients with 1p LOH and 1p ROH primary tumours. Conclusions: 91% of repeat biopsies of oligodendroglial tumors, demonstrated persistent 1p/19q LOH. Therefore, progression of 1p/19q LOH primary tumours is not due to a proliferating sub-group of chemo-resistant, 1p ROH clonagens. We propose that additional mutations contribute to this aggressive phenotype. No significant financial relationships to disclose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».