MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3022069165 · doi:10.1038/s41467-020-16178-9

Variation among 532 genomes unveils the origin and evolutionary history of a global insect herbivore

2020· article· en· W3022069165 sur OpenAlexafffund
Minsheng You, Fushi Ke, Shijun You, Zhangyan Wu, Qingfeng Liu, Weiyi He, Simon W. Baxter, Zhiguang Yuchi, Liette Vasseur, Geoff M. Gurr, Christopher M. Ward, Hugo Cerda, Guang Yang, Peng Lü, Yuan-Chun Jin, Miao Xie, Lijun Cai, Carl J. Douglas, Murray B. Isman, Mark S. Goettel, Qisheng Song, Qing‐Hai Fan, Gefu Wang‐Pruski, David C. Lees, Zhen Yue, Jianlin Bai, Tiansheng Liu, Lianyun Lin, Yunkai Zheng, Zhaohua Zeng, Sheng Lin, Yue Wang, Qian Zhao, Xiaofeng Xia, Wenbin Chen, Li‐Lin Chen, Mingmin Zou, Jinying Liao, Qiang Gao, Xiaodong Fang, Ye Yin, Huanming Yang, Jian Wang, Liwei Han, Yingjun Lin, Yanping Lu, Mousheng Zhuang

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensDalhousie UniversityBrock UniversityAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaRecruitment Program of Global ExpertsFujian Agriculture and Forestry UniversityUniversity of British ColumbiaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésHerbivoreVariation (astronomy)InsectBiologyGenomeEvolutionary biologyGenetic variationEcologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diamondback moth, Plutella xylostella is a cosmopolitan pest that has evolved resistance to all classes of insecticide, and costs the world economy an estimated US $4-5 billion annually. We analyse patterns of variation among 532 P. xylostella genomes, representing a worldwide sample of 114 populations. We find evidence that suggests South America is the geographical area of origin of this species, challenging earlier hypotheses of an Old-World origin. Our analysis indicates that Plutella xylostella has experienced three major expansions across the world, mainly facilitated by European colonization and global trade. We identify genomic signatures of selection in genes related to metabolic and signaling pathways that could be evidence of environmental adaptation. This evolutionary history of P. xylostella provides insights into transoceanic movements that have enabled it to become a worldwide pest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,216

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetPlant and animal studiesTravaux en français237 207