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Enregistrement W3022265443 · doi:10.1136/gutjnl-2020-320726

Comprehensive characterisation of pancreatic ductal adenocarcinoma with microsatellite instability: histology, molecular pathology and clinical implications

2020· review· en· W3022265443 sur OpenAlexaff
Claudio Luchini, Lodewijk A.A. Brosens, Laura D. Wood, Deyali Chatterjee, Jae Il Shin, Concetta Sciammarella, Giulia Fiadone, Giuseppe Malleo, Roberto Salvia, Valentyna Kryklyva, Maria Liliana Piredda, Liang Cheng, Rita T. Lawlor, Volkan Adsay, Aldo Scarpa

Notice bibliographique

RevueGut · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity Hospital Foundation
Organismes subventionnairesFondazione Cassa di Risparmio di Verona Vicenza Belluno e AnconaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroKWF Kankerbestrijding
Mots-clésMicrosatellite instabilityKRASPancreatic cancerAdenocarcinomaMedicineOncologyDNA mismatch repairInternal medicineCancerPathologyColorectal cancerCancer researchBiologyMicrosatelliteGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective Recently, tumours with microsatellite instability (MSI)/defective DNA mismatch repair (dMMR) have gained considerable interest due to the success of immunotherapy in this molecular setting. Here, we aim to clarify clinical-pathological and/or molecular features of this tumour subgroup through a systematic review coupled with a comparative analysis with existing databases, also providing indications for a correct approach to the clinical identification of MSI/dMMR pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Design PubMed, SCOPUS and Embase were searched for studies reporting data on MSI/dMMR in PDAC up to 30 November 2019. Histological and molecular data of MSI/dMMR PDAC were compared with non-MSI/dMMR PDAC and with PDAC reference cohorts (including SEER database and The Cancer Genome Atlas Research Network - TCGA project). Results Overall, 34 studies with 8323 patients with PDAC were included in the systematic review. MSI/dMMR demonstrated a very low prevalence in PDAC (around 1%–2%). Compared with conventional PDAC, MSI/dMMR PDAC resulted strongly associated with medullary and mucinous/colloid histology (p<0.01) and with a KRAS / TP53 wild-type molecular background (p<0.01), with more common JAK genes mutations. Data on survival are still unclear. Conclusion PDAC showing typical medullary or mucinous/colloid histology should be routinely examined for MSI/dMMR status using specific tests (immunohistochemistry, followed by MSI-PCR in cases with doubtful results). Next-generation sequencing (NGS) should be adopted either where there is limited tissue or as part of NGS tumour profiling in the context of precision oncology, acknowledging that conventional histology of PDAC may rarely harbour MSI/dMMR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,905
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations241
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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