MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3022362948 · doi:10.1038/s42003-020-0942-0

Methylation deficiency disrupts biological rhythms from bacteria to humans

2020· article· en· W3022362948 sur OpenAlexaff
Jean‐Michel Fustin, Shiqi Ye, Christin Rakers, Kensuke Kaneko, Kazuki Fukumoto, Mayu Yamano, Marijke Versteven, Ellen Grünewald, Samantha J. Cargill, T. Katherine Tamai, Yao Xu, Maria Luísa Jabbur, Rika Kojima, Melisa L. Lamberti, Kumiko Yoshioka-Kobayashi, David Whitmore, Stephanie Tammam, P. Lynne Howell, Ryoichiro Kageyama, Takuya Matsuo, Ralf Stanewsky, Diego A. Golombék, Carl Hirschie Johnson, Hideaki Kakeya, Gerben van Ooijen, Hitoshi Okamura

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesJapan Science and Technology AgencyNational Institutes of HealthKobayashi International Scholarship FoundationUK Research and InnovationDeutsche ForschungsgemeinschaftMochida Memorial Foundation for Medical and Pharmaceutical ResearchCore Research for Evolutional Science and TechnologyMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Institute of General Medical SciencesKato Memorial Bioscience FoundationUniversidad Nacional de QuilmesSenri Life Science FoundationAgencia Nacional de Promoción Científica y TecnológicaWellcome Trust
Mots-clésBiologyMethylationCircadian rhythmCircadian clockBacterial circadian rhythmsCell cycleCyanobacteriaDNA methylationOrganismModel organismCell biologyGeneticsBacteriaGeneNeuroscienceGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The methyl cycle is a universal metabolic pathway providing methyl groups for the methylation of nuclei acids and proteins, regulating all aspects of cellular physiology. We have previously shown that methyl cycle inhibition in mammals strongly affects circadian rhythms. Since the methyl cycle and circadian clocks have evolved early during evolution and operate in organisms across the tree of life, we sought to determine whether the link between the two is also conserved. Here, we show that methyl cycle inhibition affects biological rhythms in species ranging from unicellular algae to humans, separated by more than 1 billion years of evolution. In contrast, the cyanobacterial clock is resistant to methyl cycle inhibition, although we demonstrate that methylations themselves regulate circadian rhythms in this organism. Mammalian cells with a rewired bacteria-like methyl cycle are protected, like cyanobacteria, from methyl cycle inhibition, providing interesting new possibilities for the treatment of methylation deficiencies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,640
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCommunications BiologyMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207