MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3022545044 · doi:10.1158/0008-5472.can-19-1523

Pattern of Invasion in Human Pancreatic Cancer Organoids Is Associated with Loss of SMAD4 and Clinical Outcome

2020· article· en· W3022545044 sur OpenAlexafffund
Wenjie Huang, Bernat Navarro-Serer, Yea Ji Jeong, Peter Chianchiano, Limin Xia, Claudio Luchini, Nicola Veronese, Cameron Dowiak, Tammy Ng, María A. Trujillo, Bo Huang, Michael J. Pflüger, Anne M. Macgregor‐Das, Gemma Lionheart, Danielle Jones, Kohei Fujikura, Kim-Vy Nguyen-Ngoc, Neil M. Neumann, Vincent P. Groot, Alina Hasanain, A. Floortje van Oosten, Sandra E. Fischer, Steven Gallinger, Aatur D. Singhi, Amer H. Zureikat, Randall E. Brand, Matthias M. Gaida, Stefan Heinrich, Richard A. Burkhart, Jin He, Christopher L. Wolfgang, Michael Goggins, Elizabeth D. Thompson, Nicholas J. Roberts, Andrew J. Ewald, Laura D. Wood

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesPancreatic Cancer Research FundTerry Fox Research InstituteGerald O. Mann Charitable FoundationNational Cancer InstituteCanadian Cancer Society Research InstituteNational Institutes of HealthSidney Kimmel Foundation for Cancer ResearchOntario Institute for Cancer ResearchPrincess Margaret Cancer FoundationGovernment of OntarioAmerican Cancer Society
Mots-clésOrganoidPancreatic cancerCancerOncologyInternal medicineMedicineOutcome (game theory)BiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is an aggressive malignancy characterized by extensive local invasion and systemic spread. In this study, we employed a three-dimensional organoid model of human pancreatic cancer to characterize the molecular alterations critical for invasion. Time-lapse microscopy was used to observe invasion in organoids from 25 surgically resected human PDAC samples in collagen I. Subsequent lentiviral modification and small-molecule inhibitors were used to investigate the molecular programs underlying invasion in PDAC organoids. When cultured in collagen I, PDAC organoids exhibited two distinct, morphologically defined invasive phenotypes, mesenchymal and collective. Each individual PDAC gave rise to organoids with a predominant phenotype, and PDAC that generated organoids with predominantly mesenchymal invasion showed a worse prognosis. Collective invasion predominated in organoids from cancers with somatic mutations in the driver gene SMAD4 (or its signaling partner TGFBR2). Reexpression of SMAD4 abrogated the collective invasion phenotype in SMAD4-mutant PDAC organoids, indicating that SMAD4 loss is required for collective invasion in PDAC organoids. Surprisingly, invasion in passaged SMAD4-mutant PDAC organoids required exogenous TGFβ, suggesting that invasion in SMAD4-mutant organoids is mediated through noncanonical TGFβ signaling. The Rho-like GTPases RAC1 and CDC42 acted as potential mediators of TGFβ-stimulated invasion in SMAD4-mutant PDAC organoids, as inhibition of these GTPases suppressed collective invasion in our model. These data suggest that PDAC utilizes different invasion programs depending on SMAD4 status, with collective invasion uniquely present in PDAC with SMAD4 loss. Significance: Organoid models of PDAC highlight the importance of SMAD4 loss in invasion, demonstrating that invasion programs in SMAD4-mutant and SMAD4 wild-type tumors are different in both morphology and molecular mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,258
Tête enseignante GPT0,514
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetPancreatic and Hepatic Oncology ResearchTravaux en français237 207