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Enregistrement W3023012939 · doi:10.29267/mxjb.2020.5.2.120

Genetic structure of Platanus mexicana var. mexicana (Platanaceae) in southern Mexico

2020· article· en· W3023012939 sur OpenAlexaff
Dulce María Galván‐Hernández, Pablo Octavio‐Aguilar, Óscar Carmona-Hernández, Hugo Asselin, Josè Armando Lozada-García

Notice bibliographique

RevueMexican Journal of Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversité du Québec en Abitibi-Témiscamingue
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene flowBiologyGenetic structurePopulationInterspecific competitionEcologyGeographyGenetic variationGeneGeneticsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Platanus mexicana is a typical species of the tropical cloud forest with a complex biogeographical history. High adaptive radiation and interspecific hybridization have been reported for this species, leading to high genetic variability and low differentiation. However, previous studies have shown that populations in the southern part of the species’ distribution in Mexico show different patterns. Therefore, this research aimed at characterizing the genetic structure of three Platanus mexicana populations in southern Mexico. The results revealed significant differences between the populations in Oaxaca, Veracruz and Chiapas (FST = 0.235 ± 0.08), whereas there was evidence of gene flow between the two northwestern populations (Nm = 1.5). Bayesian analysis of allele frequencies showed high selection pressure in Veracruz. Furthermore, the alleles that shifted away from the neutral model were overrepresented in Chiapas. The Oaxaca population had the highest genetic variability values (He = 0.25; P = 68.7), whereas the Chiapas population displayed the highest differentiation (Nei = 0.134). Considering the biogeographical history and topographic heterogeneity of the region, the results suggest three differentiation processes: presence of a climate refugium in Oaxaca, allopatry between Veracruz and Oaxaca, and vicariance in Chiapas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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