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Enregistrement W3023998728 · doi:10.1101/2020.05.15.066662

Late Quaternary habitat suitability models for chimpanzees ( <i>Pan troglodytes</i> ) since the Last Interglacial (120,000 BP)

2020· preprint· en· W3023998728 sur OpenAlexaff
Christopher D. Barratt, Jack D. Lester, Paolo Gratton, Renske E. Onstein, Ammie K. Kalan, Maureen S. McCarthy, Gaëlle Bocksberger, Lauren C. White, Linda Vigilant, Paula Dieguez, Abdulai Barrie, Thierry Aebischer, Anthony Agbor, Alfred Kwabena Assumang, Emma Bailey, Mattia Bessone, Bartelijntje Buys, Joana Silva Carvalho, Rebecca Chancellor, Heather Cohen, Emmanuel Danquah, Tobias Deschner, Zacharie N. Dongmo, Osiris A. Doumbé, Jef Dupain, Chris S. Duvall, Manasseh Eno‐Nku, Gilles Etoga, Anh Galat‐Luong, Rosa M. Garriga, Sylvain Gatti, Andrea Ghiurghi, Annemarie Goedmakers, Anne‐Céline Granjon, Dismas Hakizimana, Nadia Haydar, Josephine Head, Daniela Hedwig, Ilka Herbinger, Veerle Hermans, Sorrel Jones, Jessica Junker, Parag Kadam, Mohamed Kambi, Ivonne Kienast, Célestin Yao Kouakou, Kouamé Paul N’Goran, Kevin E. Langergraber, Juan Lapuente, Anne Laudisoit, Kevin Lee, Fiona Maisels, Deborah L. Moore, Bethan J. Morgan, Emily Neil, Sonia Nicholl, Louis Nkembi, Anne Ntongho, Christopher Orbell, Lucy Jayne Ormsby, Liliana Pacheco, A. Piel, Lilian Pintea, Andrew J. Plumptre, Aaron Rundus, Crickette Sanz, Volker Sommer, Tenekwetche Sop, Fiona A. Stewart, Jacqueline Sunderland‐Groves, Nikki Tagg, Angelique Todd, Els Ton, Joost van Schijndel, Hilde Vanleeuwe, Elleni Vendras, Adam Welsh, José Francisco Carminatti Wenceslau, Erin G. Wessling, Jacob Willie, Roman M. Wittig, Yoshihiro Nakashima, Yisa Ginath Yuh, Kyle Yurkiw, Christophe Boesch, Mimi Arandjelovic, Hjalmar S. Kühl

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePrimate Behavior and Ecology
Établissements canadiensConcordia UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigHelmholtz-Zentrum für UmweltforschungDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésTroglodytesEcologyHabitatInterglacialBiological dispersalGeographyQuaternaryPopulationTaxonBiologyPaleontologyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim Paleoclimate reconstructions have enhanced our understanding of how past climates may have shaped present-day biodiversity. We hypothesize that habitat stability in historical Afrotropical refugia played a major role in the habitat suitability and persistence of chimpanzees ( Pan troglodytes ) during the late Quaternary. We aimed to build a dynamic model of changing habitat suitability for chimpanzees at fine spatio-temporal scales to provide a new resource for understanding their ecology, behaviour and evolution. Location Afrotropics. Taxon Chimpanzee ( Pan troglodytes ), including all four subspecies ( P. t. verus, P. t. ellioti, P. t. troglodytes, P. t. schweinfurthii ). Methods We used downscaled bioclimatic variables representing monthly temperature and precipitation estimates, historical human population density data and an extensive database of georeferenced presence points to infer chimpanzee habitat suitability at 62 paleoclimatic time periods across the Afrotropics based on ensemble species distribution models. We mapped habitat stability over time using an approach that accounts for dispersal between time periods, and compared our modelled stability estimates to existing knowledge of Afrotropical refugia. Our models cover a spatial resolution of 0.0467 degrees (approximately 5.19 km 2 grid cells) and a temporal resolution of every 1,000–4,000 years dating back to the Last Interglacial (120,000 BP). Results Our results show high habitat stability concordant with known historical forest refugia across Africa, but suggest that their extents are underestimated for chimpanzees. We provide the first fine-grained dynamic map of historical chimpanzee habitat suitability since the Last Interglacial which is suspected to have influenced a number of ecological-evolutionary processes, such as the emergence of complex patterns of behavioural and genetic diversity. Main Conclusions We provide a novel resource that can be used to reveal spatio-temporally explicit insights into the role of refugia in determining chimpanzee behavioural, ecological and genetic diversity. This methodology can be applied to other taxonomic groups and geographic areas where sufficient data are available.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,600
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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