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Enregistrement W3024051201 · doi:10.1097/00007890-201407151-00684

Endothelial Activation, Quantified By Electron Microscopy Scoring or Multiplexed Gene Expression, Predicts Accelerated Graft Loss in Patients With Transplant Glomerulopathy.

2014· article· en· W3024051201 sur OpenAlexaff
Paula Blanco, Shahid Husain, Philip F. Halloran, B. Sis

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal and Vascular Pathologies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectron microscopeGene expressionPathologyGeneMedicineBiologyGeneticsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transplant glomerulopathy (TG) is a sign of chronic kidney transplant damage with poor survival and no effective therapies. However, some patients with TG stay free of dialysis for years. There are significant limitations in the understanding of disease progression in TG. We aimed to explore genome-wide transcription profiles of TG and their relationship with ultrastructural changes in kidney biopsies and graft survival. The study included kidney allograft biopsies for cause from 40 patients with TG and post-transplant time matched 54 control patients without TG. We developed an electron microscopical (EM) scoring system to semi-quantify morphological profiles of microvascular endothelial cells of glomerular and peritubular capillaries (cytoplasmic swelling, loss of fenestrations, subendothelial widening, microvilli) and podocytes (cytoplasmic swelling, foot process effacement) and recorded an EM sum-score for endothelial cells and podocytes. The interobserver reproducibility of endothelial and podocyte EM scores were %99.2 and 99.1% respectively. A class comparison of microarrays showed 34 probe sets as higher in TG vs. non-TG, including 7 endothelial transcripts (i.e. DARC, VWF, MCAM, ICAM1) and 6 Fc receptor transcripts (i.e. FCGR3A,B, FCGR2A, FCGR1B), suggesting that endothelial activation and activating Fc receptors are involved in pathogenesis of TG. Microvascular endothelial EM sum-scores were higher in TG vs. non-TG biopsies and positively correlated with molecular disturbances, particularly transcripts reflecting endothelial activation, NK cell burden, and interferon-gamma effects (p<0.001). Podocyte EM sum-scores were not different between TG and non-TG. We stratified TG into 2 prognostic groups using either molecularly or electron microscopically defined endothelial activation: progressive TG kidneys with accelerated graft loss and non-progressive TG kidneys with no significant graft loss. In multivariate survival models, endothelial EM sum-score (p=0.007) and endothelial gene set expression (p=0.029) were independent prognostic factors after adjusting for clinical and pathological confounders (C4d, glomerular double contour cg-score, donor specific antibody, proteinuria, eGFR at time of biopsy, and interstitial fibrosis ci-score). Thus, increased renal endothelial activation seems related to disease progression in TG. Endothelial EM scoring or endothelial gene signatures can serve as predictive biomarkers in patients with TG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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