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Enregistrement W3024140734 · doi:10.1002/9781119187547.ch17

Clinical Validation and Biomarker Translation

2020· other· en· W3024140734 sur OpenAlexaff
Ji‐Young V. Kim, Raymond T. Ng, Robert Balshaw, Paul Keown, Robert McMaster, Bruce M. McManus, Karen Lam, Scott J. Tebbutt

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typeother
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBiosimilars and Bioanalytical Methods
Établissements canadiensPrevention of Organ Failure
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomarkerBiomarker discoveryFood and drug administrationComputer scienceTranslational researchBench to bedsideData scienceRisk analysis (engineering)MedicineProteomicsComputational biologyMedical physicsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter examines the current practice of biomarker validation and qualification and provides developing efforts in the regulatory sectors in establishing guidelines and standards that can facilitate efficient biomarker discovery and development pipelines. Great efforts are being undertaken to accelerate the acceptance of biomarkers from exploratory to valid with a goal to streamline the translation of biomarkers from basic science and discovery to clinical use. Biomarker diagnostics can be filed as laboratory-developed tests and sold as the in-house performance of the test as a service or sold as a kit after obtaining premarket regulatory clearance from the Food and Drug Administration (FDA). FDA-approved biomarkers can be sold as in vitro diagnostics for their specified purpose and intended use after obtaining premarket regulatory clearance from the FDA to sell them as diagnostic kits or companion diagnostics. Recent technological advancements in high-throughput omics techniques, such as genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics, have catalyzed discoveries of novel biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,091
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,148
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,481

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0910,148
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0020,008
Communication savante0,0120,006
Science ouverte0,0030,009
Intégrité de la recherche0,0050,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,019

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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