Prompt recognition of infectious pulmonary tuberculosis is critical to achieving elimination goals: a retrospective cohort study
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: All pulmonary tuberculosis (PTB) cases are presumed to be infectious to some degree. This spectrum of infectiousness is independently described by both the acid-fast bacilli smear and radiographic findings. Smear-positive patients with chest radiographic findings that are typical for adult-type PTB are believed to be most infectious. HYPOTHESIS: Characterisation of the presumed most infectious PTB case is possible by reference to readily available clinical features and laboratory results. METHODS: Retrospective cohort study of adult, culture-positive PTB cases (151 smear-positive; 162 smear-negative) diagnosed between 1 January 2013 and 30 April 2017 in Canada. We describe cases according to demographic, clinical and laboratory features. We use multivariable multinomial logistic regression to estimate the relative risk ratio (RRR) with 95% CI of features associated with an outcome of smear-positive PTB, characterised by 'typical' chest radiograph findings. RESULTS: Being Canadian-born, symptomatic, having a subacute duration of symptoms and broad-spectrum antibiotic prescriptions were all more commonly associated with smear-positive than smear-negative disease (36% vs 20%; 95% vs 63%; 88% vs 54%; and 59% vs 28%, respectively). After combining smear status and radiographic features, we show that smear-positive patients with typical chest radiographs were younger, had a longer duration of symptoms (RRR 2.41; 95% CI 1.01 to 5.74 and 2.93; 95% CI 1.20 to 7.11, respectively) and were less likely to be foreign-born, or have a moderate to high-risk factor for reactivation (RRR 0.40; 95% CI 0.17 to 0.92 and 0.18; 95% CI 0.04 to 0.71, respectively) compared with smear-negative patients with atypical chest radiograph findings. CONCLUSION: A clear picture of the presumed most infectious PTB case emerges from available historical and laboratory information; vigilance for this presentation by front-line providers will support elimination strategies aimed at reducing transmission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».