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Enregistrement W3028245882 · doi:10.1038/s41598-020-65109-7

SNHG7 is a lncRNA oncogene controlled by Insulin-like Growth Factor signaling through a negative feedback loop to tightly regulate proliferation

2020· article· en· W3028245882 sur OpenAlexfundno aff
David N. Boone, Andrew Warburton, Sreeroopa Som, Adrian V. Lee

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthHillman FoundationSusan G. KomenBreast Cancer Research FoundationUniversity of PittsburghMcGill University
Mots-clésGene silencingBiologyOncogeneSignal transductionGrowth factorCancer researchCell growthCell cycleMAPK/ERK pathwayGeneCell biologyInsulin-like growth factorLong non-coding RNARegulation of gene expressionGeneticsReceptorDownregulation and upregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evidence suggests Insulin-like growth factor 1 (IGF1) signaling is involved in the initiation and progression of a subset of breast cancers by inducing cell proliferation and survival. Although the signaling cascade following IGF1 receptor activation is well-studied, the key elements of the transcriptional response governing IGF1's actions are not well understood. Recent studies reveal that the majority of the genome is transcribed and that there are more long non-coding RNAs (lncRNAs) than protein coding genes, several of which are dysregulated in human cancer. However, studies on the regulation and mechanism of action of these lncRNAs are in their infancy. Here we show that IGF1 alters the expression levels of a subset of lncRNAs. SNHG7, a member of the small nucleolar host gene family, is a highly-expressed lncRNA that is consistently and significantly down-regulated by IGF1 signaling by a post-transcriptional mechanism through the MAPK pathway. SNHG7 regulates proliferation of breast cancer cell lines in a dose-dependent manner, and silencing SNHG7 expression causes cell cycle arrest in G0/G1. Intriguingly, SNHG7 alters the expression of many IGF1 signaling intermediates and IGF1-regulated genes suggesting a feedback mechanism to tightly regulate the IGF1 response. Finally, we show in clinical data that SNHG7 is overexpressed in tumors of a subset of breast cancer patients and that these patients have lower disease-free survival than patients without elevated SNHG7 expression. We propose that SNHG7 is a lncRNA oncogene that is controlled by growth factor signaling in a feedback mechanism to prevent hyperproliferation, and that this regulation can be lost in the development or progression of breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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