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Enregistrement W3028486192 · doi:10.1093/schbul/sbaa031.080

S14. ANALYSIS OF METHYLATION AGE AND BLOOD CELL COMPOSITION IN SUBJECTS WITH CURRENT SUICIDE IDEATION

2020· article· en· W3028486192 sur OpenAlexaff
Oluwagbenga Dada, Vincenzo De Luca, Ali Bani‐Fatemi

Notice bibliographique

RevueSchizophrenia Bulletin · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésdNaMDNA methylationEpigeneticsPopulationSuicidal ideationSchizophrenia (object-oriented programming)Suicide attemptMethylationPsychologyClinical psychologyMedicineOncologyBioinformaticsPsychiatryPoison controlBiologyGeneticsInjury preventionGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Suicidal Ideation (SI) remain an important and common risk factor affecting people with SCZ, who eventually attempt or complete suicide. Then the question is, what if factors (such as stressful life events and related molecular biomarkers) known to be involved in the aetiology of SCZ could help in predicting SI in this population? The accelerated aging hypothesis of SCZ posits that physiological changes associated with normal aging occur at an earlier age in individuals with SCZ than in the general population. Importantly, epigenetic changes may constitute an important component of aging process. Based on this, the chronological age can be predicted by the epigenetic clock in a highly consistent manner. The aims of this research were to determine the effect chronological and biological age on current SI and secondly, to determine the effect of the variation of cellular blood cell composition on current SI. Methods A total of 103 participants with a DSM-IV diagnosis of schizophrenia spectrum and other psychotic disorders were recruited from the Center of Addiction and Mental Health. The SI was assessed by the Columbia-Suicide Severity Rating Scale. Genome-wide DNA methylation analysis was generated from whole blood cells. The DNA methylation was assessed using the Illumina Infinium HumanMethylation450 Bead Chip while the DNA methylation-based age prediction and white blood cell composition were performed using the statistical pipeline developed by Horvath. Results Out of 103 participants, 18 had current SI (17%) while 85 had NSI. The DNAm age correlated with chronological age in the overall sample (r=0.814, p<0.0001), NSI (r=0.823, p<0.0001) and SI subjects (r=0.734, p=0.001). The strong linear relationship between DNAm age and chronological age showed a high accuracy of the epigenetic clock. However, DNAm age acceleration residuals did not differ between NSI and SI groups (t=1.532, p= 0.129). Comparison of the cellular cell blood composition between the NSI and SI groups indicated no significant differences between the NSI and SI groups (lymphocytes (t= -0.338, p=0.736), monocytes (t=-1.405, p=0.163) and granulocytes (t=0.924, p=0.358)). Furthermore, there were no significant differences between the SI and NSI groups in the analysis of the plasmablast (t=0.138, p=0.890), CD4 naïve (t=0.010, p=0.992) and CD8 naïve (t=0.681, p=0.497) Discussion Stressful life events may change DNA methylation, which in turn can affect suicide ideation and suicidal behavior. Although SCZ is associated with age-related physiological factors, we were unable to find accelerated aging in our study. Nevertheless, we cannot rule out the possibility of other aging mechanism independent of epigenetic aging in SCZ patients. Conclusion: Further studies aimed at investigating the accelerated aging hypothesis in peripheral tissue are warranted to identify individuals with SCZ at risk for suicide. This will permit a tailored treatment and will prevent suicide in SCZ individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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