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Enregistrement W3029070434 · doi:10.1101/2020.05.28.20115782

Monitoring sick leave data for early detection of influenza outbreaks

2020· preprint· en· W3029070434 sur OpenAlexfundno aff
Tom Duchemin, Jonathan Bastard, Pearl Anne Ante-Testard, Rania Assab, Oumou Salama Daouda, Audrey Duval, Jérôme‐Philippe Garsi, Radowan Lounissi, Narimane Nekkab, Helene Neynaud, David R. Smith, William Dab, Kévin Jean, Laura Temime, Mounia N. Hocine

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAssociation Nationale de la Recherche et de la TechnologieAgence Nationale de la RechercheInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésOutbreakSick leaveAbsenteeismMedicineEmergency medicineEnvironmental healthVirologyPhysical therapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background - Workplace absenteeism increases significantly during influenza epidemics. Sick leave records may facilitate more timely detection of influenza outbreaks, as trends in increased sick leave may precede alerts issued by sentinel surveillance systems by days or weeks. Sick leave data have not been comprehensively evaluated in comparison to traditional surveillance methods. Aim - To study the performance and the feasibility of using a detection system based on sick leave data to detect influenza outbreaks Methods - Sick leave records were extracted from private French health insurance data, covering on average 209,932 companies per year across a wide range of sizes and sectors. We used linear regression to estimate the weekly number of new sick leave spells from 2010 to 2017 in 12 French regions, adjusting for trend, seasonality and worker leaves. Outbreaks were detected using a 95%-prediction interval. This method was compared to results from the French Sentinelles network, a gold-standard primary care surveillance system currently in place. Results - Using sick leave data, we detected 92% of reported influenza outbreaks between 2016 and 2017, on average 5.88 weeks prior to outbreak peaks. Compared to the existing Sentinelles model, our method had high sensitivity (89%) and specificity (86%), and detected outbreaks on average 2.5 weeks earlier. Conclusion - Sick leave surveillance could be a sensitive, specific and timely tool for detection of influenza outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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