MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3030320535 · doi:10.1101/591164

A Chemical Probe of CARM1 Alters Epigenetic Plasticity against Breast Cancer Cell Invasion

2019· preprint· en· W3030320535 sur OpenAlexafffund
Xiao-Chuan Cai, Tuo Zhang, Eui‐Jun Kim, Ming Jiang, Ke Wang, Junyi Wang, Shi Chen, Nawei Zhang, Hong Wu, Fengling Li, Carlo C. dela Seña, Hong Zheng, Victor Vivcharuk, Xiang Niu, Weihong Zheng, Jonghan P Lee, Yuling Chen, Dalia Barsyte, Magda Szewczyk, Taraneh Hajian, Glorymar Ibáñez, Aiping Dong, Ludmila Dombrovsky, Zhenyu Zhang, Haiteng Deng, Jinrong Min, C.H. Arrowsmith, Linas Mažutis, Lei Shi, Masoud Vedadi, Peter J. Brown, Jenny Xiang, Li‐Xuan Qin, Wei Xu, Minkui Luo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNovartis PharmaNational Institutes of HealthMinistero dello Sviluppo EconomicoOntario Ministry of Economic Development and InnovationWestern Economic Diversification CanadaWellcome TrustNational Cancer InstituteNational Research Council CanadaBeijing Municipal Administration of HospitalsEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaSusan G. Komen for the CurePfizerUniversity of SaskatchewanNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Light SourceMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterArgonne National LaboratoryU.S. Department of Energy
Mots-clésEpigeneticsBiologyCancer cellCellCell biologyCarcinogenesisMetastasisCancer researchCancerBiochemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract CARM1 is a cancer-relevant protein arginine methyltransferase that regulates many aspects of transcription. Its pharmacological inhibition is a promising anti-cancer strategy. Here SKI-73 is presented as a CARM1 chemical probe with pro-drug properties. SKI-73 can rapidly penetrate cell membranes and then be processed into active inhibitors, which are retained intracellularly with 10-fold enrichment for days. These compounds were characterized for their potency, selectivity, modes of action, and on-target engagement. SKI-73 recapitulates the effect of CARM1 knockout against breast cancer cell invasion. Single-cell RNA-seq analysis revealed that the SKI-73 -associated reduction of invasiveness act via altering epigenetic plasticity and suppressing the invasion-prone subpopulation. Interestingly, SKI-73 and CARM1 knockout alter the epigenetic plasticity with remarkable difference, arguing distinct modes of action between the small-molecule and genetic perturbation. We therefore discovered a CARM1-addiction mechanism of cancer metastasis and developed a chemical probe to target this process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207