Antibiotic resistance surveillance in and genotyping of Neisseria gonorrhoeae isolates from Hainan province during 2011-2012
Notice bibliographique
Résumé
Objective To evaluate the antibiotic resistance in Neisseria gonorrhoeae (NG) isolates from Hainan province,and to assess their genotypes according to antibiotic resistance-associated genes.Methods Totally,214 NG strains isolated from Hainan province during 2011-2012 were included in this study.An agar dilution method was used to determine the minimum inhibitory concentrations (MICs) of ciprofloxacin,ceftriaxone,spectinomycin and tetracycline in these strains.The production of β-lactamase was tested by a paper acidometric method.PCR was performed to amplify the tetM gene in TRNG strains and TEM-1 gene in penicillinase-producing NG (PPNG) strains for their genotyping.Results Among these NG strains,7.94％ (17/214) were moderately sensitive to ciprofloxacin with a resistance rate of 92.06％ (197/214),24.30％ (52/214) were sensitive to ceftriaxone with a moderate sensitivity rate of 75.70％ (162/214),and none was resistant to spectinomycin.Additionally,39 isolates (18.22％) were concurrently resistant to both tetracycline and penicillin,66 isolates (30.84％) to penicillin and ciprofloxacin,91 isolates (42.52.％) to tetracycline and ciprofloxacin,and 37 isolates (17.29％) to tetracycline,penicillin and ciprofloxacin.Totally,101 TRNG strains were identified from all the isolates,of which,99 (98.02％)harbored the Dutch variant of the tetM gene,and 2 (1.98％) harbored the American variant.There were 65 (31.31％)PPNG strains in these isolates,among which,55 (84.62％) carried the Asian type plasmids,10 (15.38％) carried the Africa type plasmids,and none carried the Toronto or Rio type plasmids.Conclusions The NG isolates from Hainan province is highly sensitive to spectinomycin,which should serve as the first treatment choice for gonorrhea.More attention should be paid to multi-drug resistance in NG.In this region,most PPNG strains carry the Asian type plasmids,followed by the Africa type plasmids,and the Dutch variant of the tetM gene is the most common variant among TRNG strains with the American variant as the occasional form. Key words: Neisseria gonorrhoeae; Drug resistance; Genes, TetM; Genes, TEM-1; Genotype
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».