MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3033683066 · doi:10.1186/s13054-020-02993-5

Biomarkers of sepsis: time for a reappraisal

2020· review· en· W3033683066 sur OpenAlexaff
Charalampos Pierrakos, Dimitrios Velissaris, Max Bisdorff, John C. Marshall, Jean‐Louis Vincent

Notice bibliographique

RevueCritical Care · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSepsis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProcalcitoninMedicineSepsisBiomarkerIntensive care medicineDiagnostic biomarkerInternal medicineBioinformaticsDiagnostic accuracy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Sepsis biomarkers can have important diagnostic, therapeutic, and prognostic functions. In a previous review, we identified 3370 references reporting on 178 different biomarkers related to sepsis. In the present review, we evaluate the progress in the research of sepsis biomarkers. METHODS: Using the same methodology as in our previous review, we searched the PubMed database from 2009 until September 2019 using the terms "Biomarker" AND "Sepsis." There were no restrictions by age or language, and all studies, clinical and experimental, were included. RESULTS: We retrieved a total of 5367 new references since our previous review. We identified 258 biomarkers, 80 of which were new compared to our previous list. The majority of biomarkers have been evaluated in fewer than 5 studies, with 81 (31%) being assessed in just a single study. Apart from studies of C-reactive protein (CRP) or procalcitonin (PCT), only 26 biomarkers have been assessed in clinical studies with more than 300 participants. Forty biomarkers have been compared to PCT and/or CRP for their diagnostic value; 9 were shown to have a better diagnostic value for sepsis than either or both of these biomarkers. Forty-four biomarkers have been evaluated for a role in answering a specific clinical question rather than for their general diagnostic or prognostic properties in sepsis. CONCLUSIONS: The number of biomarkers being identified is still increasing although at a slower rate than in the past. Most of the biomarkers have not been well-studied; in particular, the clinical role of these biomarkers needs to be better evaluated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,045
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,099
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0450,099
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,005
Bibliométrie0,0100,009
Études des sciences et des technologies0,0020,007
Communication savante0,0100,041
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0100,021
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,188
Tête enseignante GPT0,482
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations699
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCritical CareMême sujetSepsis Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207