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Enregistrement W3034144845 · doi:10.1097/pap.0000000000000268

Molecular Genetic Features of Primary Nonurachal Enteric-type Adenocarcinoma, Urachal Adenocarcinoma, Mucinous Adenocarcinoma, and Intestinal Metaplasia/Adenoma: Review of the Literature and Next-generation Sequencing Study

2020· review· en· W3034144845 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAdvances in Anatomic Pathology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary and Genital Oncology Studies
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesUniversity of British ColumbiaUniversity of CalgaryRoyal Columbian Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASAdenocarcinomaPTENMedicineIntestinal metaplasiaPathologyMetaplasiaCancer researchInternal medicineBiologyColorectal cancerCancerDysplasiaPI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diagnosis of primary adenocarcinoma of the urinary bladder may be challenging in routine practice. These tumors may morphologically and immunohistochemically overlap with urachal adenocarcinoma and colorectal adenocarcinoma. Further, their genetic background is poorly understood. We systematically searched the PubMed database for results of complex genetic evaluation of primary bladder adenocarcinoma subtypes. Subsequently, we designed our own series of bladder lesions. We evaluated 36 cases: 16 primary enteric-type adenocarcinomas, 7 urachal enteric adenocarcinomas, 3 primary mucinous/colloid adenocarcinomas, and 10 intestinal-type metaplasia/villous adenoma. Detailed clinical data were collected, and all cases were examined using targeted next-generation sequencing. On the basis of the literature, the first mutated gene in these tumors was reported to be KRAS in 11.3% of cases, followed by TERT promoter mutations in 28.5%. In addition to KRAS and TERT, other genes were also found to be frequently mutated in primary bladder adenocarcinoma, including TP53, PIK3CA, CTNNB1, APC, FBXW7, IDH2, and RB1. In our series, the most frequent gene mutations in primary enteric-type adenocarcinomas were as follows: TP53 (56%); BRCA2, KMT2B (both 33%); NOTCH2, KDR, ARID1B, POLE, PTEN, KRAS (all 28%); in urachal enteric adenocarcinoma they were as follows: TP53 (86%); PTEN, NOTCH (both 43%); in primary mucinous/colloid adenocarcinomas they were as follows: KRAS, GRIN2A, AURKB (all 67%); and, in intestinal-type metaplasia/villous adenoma, they were as follows: APC, PRKDC (both 60%); ROS1, ATM, KMT2D (all 50%). No specific mutational pattern was identified using cluster analysis for any of the groups. Herein, we describe the pathologic features and immunohistochemical staining patterns traditionally used in the differential diagnoses of glandular lesions of the bladder in routine surgical pathology. We outline the mutational landscape of these lesions as an aggregate of published data with additional data from our cohort. Although diagnostically not discriminatory, we document that the most common genetic alterations shared between these glandular neoplasms include TP53, APC (in the Wnt pathway), and KRAS (in the MAPK pathway) mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,545
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle