Reduced HIV-1 latent reservoir outgrowth and distinct immune correlates among women in Rakai, Uganda
Notice bibliographique
Résumé
HIV-1 infection remains incurable owing to the persistence of a viral reservoir that harbors integrated provirus within host cellular DNA. Increasing evidence links sex-based differences in HIV-1 immune responses and pathogenesis; however, little is known about differences in HIV-1 infection persistence. Here, we quantified persistent HIV-1 infection in 90 adults on suppressive antiretroviral therapy in Rakai, Uganda (57 female patients). Total HIV-1 DNA was quantified by PCR, and replication-competent provirus by quantitative viral outgrowth assay (QVOA). Immune phenotyping of T cell subsets and plasma biomarkers was also performed. We found that whereas both sexes had similar total HIV DNA levels, female patients had significantly fewer resting CD4+ T cells harboring replication-competent virus, as measured by viral outgrowth in the QVOA. Factors associated with viral outgrowth differed by sex; notably, frequency of programmed cell death 1 (PD1+) CD4+ T cells correlated with reservoir size in male but not female patients. The sex-based differences in HIV-1 persistence observed in this cohort warrant additional research, especially given the widespread use of the QVOA to assess reservoir size and current explorations of PD1 agonists in cure protocols. Efforts should be made to power future cure studies to assess outcomes in both male and female patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».