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Enregistrement W3036626855 · doi:10.1101/2020.06.17.157958

Dynamic expression and localization of the LIN-2/7/10 protein scaffolding complex during <i>C. elegans</i> vulval development

2020· preprint· en· W3036626855 sur OpenAlexafffund
Kimberley D. Gauthier, Christian E. Rocheleau

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthMcGill University Health CentreUniversité Laval
Mots-clésCell biologyEndosomeColocalizationBiologyScaffold proteinGolgi apparatusCaenorhabditis elegansEndomembrane systemEpithelial polarityMembrane proteinSignal transductionBiochemistryCellMembraneEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The evolutionarily conserved LIN-2 (CASK)/LIN-7 (Lin7A-C)/LIN-10 (APBA1) complex plays an important role in regulating spatial organization of membrane proteins and signaling components. In C. elegans, the complex is essential for development of the vulva by promoting the localization of the sole Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) orthologue, LET-23, to the basolateral membrane of the vulva precursor cells (VPCs) where it can specify the vulval cell fate. However, the expression and localization of the LIN-2/7/10 complex, and how the complex regulates receptor localization, are not known. Here we describe an in vivo analysis of the complex in C. elegans VPCs. Only LIN-7 colocalizes with LET-23 EGFR at the basolateral membrane, while the LIN-2/7/10 complex components instead colocalize at cytoplasmic foci, consistent with Golgi or endosomes. LIN-10 recruits LIN-2, which in turn recruits LIN-7. We demonstrate that the complex forms in vivo with particularly strong interaction and colocalization between LIN-2 and LIN-7. Our data suggest that the LIN-2/7/10 complex forms on endomembrane compartments where it likely targets LET-23 EGFR to the basolateral membrane, and point to distinct regulation between LIN-2/7 and LIN-10. Summary Statement LIN-10 recruits LIN-2 and LIN-7 to Golgi or recycling endosomes, consistent with targeting rather than tethering the epidermal growth factor receptor to the basolateral membrane in C. elegans .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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