MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3037365329 · doi:10.1002/mp.14351

Automatic arterial input function selection in CT and MR perfusion datasets using deep convolutional neural networks

2020· article· en· W3037365329 sur OpenAlexafffund
Anthony Winder, Christopher D. d’Esterre, Bijoy K. Menon, Jens Fiehler, Nils D. Forkert

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Ischemic Stroke Management
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalHotchkiss Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCalgary FoundationCanada Research ChairsHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésConvolutional neural networkArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Computer sciencePerfusionPerfusion scanningPearson product-moment correlation coefficientGround truthDeep learningNuclear medicineMedicineRadiologyMathematicsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The computation of perfusion parameter images requires knowledge of the arterial blood flow in the form of an arterial input function (AIF). This work proposes a novel method to automatically identify AIFs in computed tomography perfusion (CTP) and dynamic susceptibility contrast perfusion-weighted MRI (PWI) datasets using a deep convolutional neural network (CNN). METHODS: One-hundred CTP and 100 PWI datasets of acute ischemic stroke patients were available for model development and evaluation. For each modality, 50 datasets were used for CNN training and 20 for validation using manually selected AIFs and non-arterial tissue concentration time curves. Model evaluation was performed using the remaining 30 independent validation datasets from each modality with manual AIF selections provided by two experts as ground truth. Additionally, AIFs were also extracted using an established automatic shape-based algorithm for comparison purposes. The extracted AIFs were compared using normalized cross-correlation and shape features as well as using the Dice similarity metric and volume of the corresponding hypoperfusion (Tmax > 6 s) lesions. RESULTS: The cross-correlation values comparing the manual AIFs and those extracted by the proposed CNN method were significantly greater than those comparing the manual AIFs to the shape-based comparison method. Likewise, hypoperfusion lesions generated using the manually selected AIFs and CNN-based AIFs showed higher Dice values compared to hypoperfusion lesions generated using the comparison AIF extraction method. Shape features for AIFs generated by the proposed method did not differ significantly from the manual AIFs, with the exception that the CNN-derived AIFs for the PWI datasets showed marginally greater peak heights. CONCLUSION: Deep convolutional neural network models are viable for the automatic extraction of the AIF from CTP and PWI datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,978
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMedical PhysicsMême sujetAcute Ischemic Stroke ManagementTravaux en français237 207