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Enregistrement W3037708341 · doi:10.1128/msphere.00521-20

Doesn’t It All Come Down to Function? How To Correlate VAR2CSA Antibodies with Protection

2020· letter· en· W3037708341 sur OpenAlexaff
Sédami Gnidehou, Stephanie K. Yanow

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2020
Typeletter
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntibodyFunction (biology)Computer scienceVirologyMedicineImmunologyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We wish to respond to the article “Going native, or the risk of overreliance on recombinant antigens” (1) by Dr. Lopez-Perez, which questions our findings that antibodies to VAR2CSA can arise outside pregnancy. She asserts that relying on antibody recognition of recombinant proteins can yield misleading data on VAR2CSA antibody responses. We agree; it is not surprising that VAR2CSA may be folded or modified differently when expressed in a variety of cell systems, and this is expected to alter the recognition of the recombinant protein by antibodies. We contend that the most important way to characterize VAR2CSA antibodies is not based exclusively on antigen recognition but on whether those antibodies block the adhesion of infected erythrocytes (IE) to the placental receptor chondroitin sulfate A (CSA). Antibodies with inhibitory activity strongly correlate with protection against pregnancy-associated malaria (PAM) (2–6). The importance of function was further emphasized by Khattab et al. in 2004 (5): “The identification of functional antibodies which appear to inhibit the binding of parasites to CSA in the placenta is crucial to developing a successful vaccination strategy against PAM.”

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,159
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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