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Enregistrement W3039220488 · doi:10.1038/s42003-020-1072-4

Salmonella-based platform for efficient delivery of functional binding proteins to the cytosol

2020· article· en· W3039220488 sur OpenAlexafffund
Antoine Chabloz, Jonas V. Schaefer, I. Kozieradzki, Shane J. F. Cronin, Daniel Strebinger, Francesca Macaluso, Jiri Wald, Terence H. Rabbitts, Andreas Plückthun, Thomas C. Marlovits, Josef Penninger

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBlood Cancer UKUniversity of British ColumbiaUniversität WienMedical Research CouncilÖsterreichischen Akademie der WissenschaftenMedizinische Universität WienBranco Weiss Fellowship – Society in ScienceFaculty of Medicine, University of British ColumbiaYale University
Mots-clésCytosolEffectorSecretionIntracellularType three secretion systemCell biologySalmonellaBiologyMacromoleculeSmall moleculeRecombinant DNAComputational biologyBacteriaBiochemistryGeneticsEnzymeVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein-based affinity reagents (like antibodies or alternative binding scaffolds) offer wide-ranging applications for basic research and therapeutic approaches. However, whereas small chemical molecules efficiently reach intracellular targets, the delivery of macromolecules into the cytosol of cells remains a major challenge; thus cytosolic applications of protein-based reagents are rather limited. Some pathogenic bacteria have evolved a conserved type III secretion system (T3SS) which allows the delivery of effector proteins into eukaryotic cells. Here, we enhance the T3SS of an avirulent strain of Salmonella typhimurium to reproducibly deliver multiple classes of recombinant proteins into eukaryotic cells. The efficacy of the system is probed with both DARPins and monobodies to functionally inhibit the paradigmatic and largely undruggable RAS signaling pathway. Thus, we develop a bacterial secretion system for potent cytosolic delivery of therapeutic macromolecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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