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Enregistrement W3039523463 · doi:10.1016/j.jmoldx.2020.06.008

Improved Diagnosis of Rare Disease Patients through Systematic Detection of Runs of Homozygosity

2020· article· en· W3039523463 sur OpenAlexafffund
Leslie Matalonga, Steven Laurie, Anastasios Papakonstantinou, Davide Piscia, Elisabetta Mereu, Gemma Bullich, Rachel Thompson, Rita Horváth, Luis A. Pérez‐Jurado, Olaf Rieß, Marta Gut, Gert‐Jan B. van Ommen, Hanns Lochmüller, Sergi Beltrán, Alessandra Renieri, Ali Dursun, Antoni Matilla‐Dueñas, Bru Cormand, Carlo Rivolta, Carmen Ayuso, Carmen Espinós, Christian Scerri, Dilek Yalnızoğlu, Doriette Soler, Éva Morava, Fabrizio Barbetti, Francesca Forzano, Francesca Mari, Francesco Muntoni, Frederic Tort, Henry Houlden, María‐Isabel Tejada, Jan Senderek, Javier Benı́tez, Javier Corral De La Calle, Jordi Serra, José M. Millán, José Carlos Segovia, Juan Ramón Gimeno Blanes, Judith Armstrong, Laura Vilarinho, Lluı́s Montoliu, Maria Antonietta Mencarelli, Marina Mora, Paola Bianchi, Pavel Seeman, Perry Elliott, Alessandra Ferlini, Alexis Brice, Sarah J. Tabrizi, Thomas Klockgether, Vincent Timmerman, Volker Straub, Semra Hız Kurul, Yavuz Oktay, Serdal Güngör, Ahmet Yaramış, Uluç Yiş, Alfons Macaya, Antònia Ribes, Aurora Pujol, Conxi Lázaro, Daniel Grinberg, Eduardo F. Tizzano, Francesc Cardellach, Francesc Palau, Montserrat Milà, P. Gallano, Rafael Artuch, Ramon MartiSeves, Gonzalo Villanueva, Silvia M. Vidal, Glòria Garrabou, Susana Balcells, Roser Urreizti, Ivon Cuscó, Irene Valenzuela

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Diagnostics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilDepartament de Salut, Generalitat de CatalunyaInstituto de Salud Carlos IIIEuropean Research CouncilMedical Research CouncilSeventh Framework ProgrammeHorizon 2020 Framework ProgrammeMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaNational Institute for Health and Care ResearchGeneralitat de CatalunyaEuropean Regional Development FundEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchWellcomeEuropean Molecular Biology LaboratoryNewton FundWellcome Trust
Mots-clésConsanguinityRuns of HomozygosityExome sequencingDisease gene identificationExomeInbreedingBiologyGeneticsDiseaseMedicinePopulationMutationInternal medicineGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,540

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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