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Enregistrement W3039778756 · doi:10.1101/2020.07.01.180729

Human bone mesoscale 3D structure revisited by plasma focused ion beam serial sectioning

2020· preprint· en· W3039778756 sur OpenAlexaff
Dakota M. Binkley, Joseph Deering, Hui Yuan, Aurélien Gourrier, Kathryn Grandfield

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced X-ray Imaging Techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrofibrilLamellar structureMaterials scienceMineralization (soil science)NanometreCollagen fibrilFocused ion beamMesoscale meteorologyBiomedical engineeringChemistryBiophysicsIonComposite materialGeologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Visualizing bone mineralization and collagen microfibril organization at intermediate scales between the nanometer and the 100s of microns range, the mesoscale, is still an important challenge. Similarly, visualizing cellular components which locally affect the tissue structure requires a precision of a few tens of nanometers at maximum while spanning several tens of micrometers. To address this issue, we employed a plasma focused ion beam (PFIB) equipped with a scanning electron microscope (SEM) to sequentially section nanometer-scale layers of demineralized and mineralized human femoral lamellar bone over volumes of approximately 46 × 40 × 9 μm 3 , and 29 × 26 × 9 μm 3 , respectively. This large scale view retained high enough resolution to visualize the collagen microfibrils while partly visualizing the lacuno-canalicular network (LCN) in three-dimensions (3D). We showed that serial sectioning can be performed on mineralized sections, and does not require demineralization. Moreover, this method revealed ellipsoidal mineral clusters, noted by others in high resolution studies, as a ubiquitous motif in lamellar bone over tens of microns, suggesting a heterogeneous and yet regular pattern of mineral deposition past the single collagen fibril level. These findings are strong evidence for the need to revisit bone mineralization over multi-length scales. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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