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Enregistrement W3039970306 · doi:10.24908/iqurcp.14029

Identifying the repellent genes in Cannabis (C. sativa) through CRISPR screening. The hidden use of Marijuana

2020· article· en· W3039970306 sur OpenAlexvenueno aff
Ambre Lambert, Shanwa Lee, Rachel Miller

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect Pest Control Strategies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCannabis sativaMeloidogyne incognitaTerra incognitaBiologyCannabisGenePesticideBiotechnologyToxicologyBotanyNematodeAgronomyGeneticsMedicineEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemical pesticides have caused numerous deaths of people, animals, and plants. As a result, alternative pesticides which are health beneficial and ecological are needed. Cannabis sativa,​ known for its psychoactive effects, can be the solution to this problem. It has excellent repellent characteristics as seen through its use as a companion plant, as well as in-vitro studies. However it has its drawbacks due its controversial nature and lack of research. To solve this problem, our paper aims to locate the non-vital genes in ​C.sativa that cause its repellent effects (R-genes) through CRISPR screening. To optimally identify the R-genes, the random knocked out genes of ​C.sativa were compared to the percentage of alive root-knot nematodes (​M.incognita​) in the plant’s soil. In our experiment, four plants were established per sample: Plant A which is a normal ​Cannabis sativa​, Plant B which is a normal ​Cannabis sativa being infected by ​M.incognita,​ Plant C which is a genetically modified ​Cannabis sativa​, and Plant D which is the same as Plant C except it is being infected by ​M.incognita.​ Then the percentage of alive nematodes will be compared in Plant B and D to identify the R genes. The discovery of R-genes is important as it can be used to discover a new class of repellent molecules. They can also be inserted into crops or household plants, giving them ​Cannabis sativa​’s repellent effects, and benefiting agricultural and health fields.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,283
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,077 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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