MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3040365468 · doi:10.1002/acn3.51103

Neuronal RNA‐binding protein dysfunction in multiple sclerosis cortex

2020· article· en· W3040365468 sur OpenAlexafffund
Hannah E. Salapa, Catherine Hutchinson, Bogdan Popescu, Michael C. Levin

Notice bibliographique

RevueAnnals of Clinical and Translational Neurology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanCameco (Canada)
Organismes subventionnairesSaskatchewan Health Research FoundationUniversity of Saskatchewan
Mots-clésNeurodegenerationRNA-binding proteinAmyotrophic lateral sclerosisStress granuleBiologyRNAHeterogeneous nuclear ribonucleoproteinNeurosciencePathologyCell biologyMedicineRibonucleoproteinMessenger RNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Neurodegeneration is thought to be the primary cause of neurological disability in multiple sclerosis (MS). Dysfunctional RNA-binding proteins (RBPs) including their mislocalization from nucleus to cytoplasm, stress granule formation, and altered RNA metabolism have been found to underlie neurodegeneration in amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia. Yet, little is known about the role of dysfunctional RBPs in the pathogenesis of neurodegeneration in MS. As a follow-up to our seminal finding of altered RBP function in a single case of MS, we posited that there would be evidence of RBP dysfunction in cortical neurons in MS. METHODS: Cortical neurons from 12 MS and six control cases were analyzed by immunohistochemistry for heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 (hnRNP A1) and TAR-DNA-binding protein-43 (TDP-43). Seven distinct neuronal phenotypes were identified based on the nucleocytoplasmic staining of these RBPs. Statistical analyses were performed by analyzing each phenotype in relation to MS versus controls. RESULTS: Analyses revealed a continuum of hnRNP A1 and TDP-43 nucleocytoplasmic staining was found in cortical neurons, from neurons with entirely nuclear staining with little cytoplasmic staining in contrast to those with complete nuclear depletion of RBPs concurrent with robust cytoplasmic staining. The neuronal phenotypes that showed the most nucleocytoplasmic mislocalization of hnRNP A1 and TDP-43 statistically distinguished MS from control cases (P < 0.01, P < 0.001, respectively). INTERPRETATION: The discovery of hnRNP A1 and TDP-43 nucleocytoplasmic mislocalization in neurons in MS brain demonstrate that dysfunctional RBPs may play a role in neurodegeneration in MS, as they do in other neurological diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,326
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,070 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of Clinical and Translational NeurologyMême sujetAmyotrophic Lateral Sclerosis ResearchTravaux en français237 207