MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3041117374

Parallel Adaptations to High Temperatures in the Archaean Eon

2010· article· en· W3041117374 sur OpenAlexaff
Bastien Boussau, Samuel Blanquart, Anamaria Necşulea, Nicolas Lartillot, Manolo Gouy

Notice bibliographique

RevueRePEc: Research Papers in Economics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAncestorArchaeaMost recent common ancestorEvolutionary biologyThermophileGenomePhylogenetic treeExtremophileTree of life (biology)AbiogenesisPhylogeneticsArcheanGeneticsEcologyGenePaleontologyBacteriaGeography
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

LUCA blows hot and cold There is a fascination about the quest to learn more about 'LUCA', the hypothetical last universal common ancestor from which all current living organisms are descended. Fossil evidence from the time, 3.5 to 3.8 billion years ago, is sparse and so LUCA hunters rely on indirect evidence for information on LUCA's biology and environment. Reconstructions of ancestral protein sequences based on genetic evidence from extant genomes pointed to a hot environment, and a thermophilic LUCA. But ribosomal RNA sequences were thought consistent with a cooler environment. A new 'molecular thermometer' method may have resolved this apparent discrepancy. The analysis of rRNA and protein sequences from hundreds of modern species using the latest mathematical models of molecular evolution suggests that there were two phases of environmental temperature change. What was to become LUCA was first mesophilic, living in waters at about 60°C, then adapted to higher temperatures, above 70°C, to produce a thermophilic common ancestor. As the oceans then cooled the Bacteria and Archaea–Eukaryota diversified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueRePEc: Research Papers in Economics→Même sujetGenomics and Phylogenetic Studies→Travaux en français237 207→