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Enregistrement W3041504593 · doi:10.1101/2020.07.06.20147520

A Trans-Omic Mendelian Randomization Study of Parental Lifespan Uncovers Novel Aging Biology and Drug Candidates for Human Healthspan Extension

2020· preprint· en· W3041504593 sur OpenAlexafffund
Nicolas Perrot, William Pelletier, Jerome Bourgeault, Christian Couture, Zhonglin Li, Patricia L. Mitchell, Nooshin Ghodsian, Yohan Bossé, Sébastien Thériault, Patrick Mathieu, Benoît J. Arsenault

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesCommon FundNational Human Genome Research InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthNIH Office of the DirectorNational Heart, Lung, and Blood InstituteFonds de Recherche du Québec - SantéNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésPhenomeMendelian randomizationBiologyGeneticsEpistasisGeneMendelian inheritanceHaptoglobinComputational biologyTranscriptomeGenetic architectureDiseaseLongevityGenotypeEvolutionary biologyGene expressionQuantitative trait locusGenomeMedicineGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of parental lifespan has emerged as an innovative tool to advance aging biology and our understanding of the genetic architecture of human longevity and healthspan. Here, we leveraged summary statistics of a genome-wide association study including over one million parental lifespans to identify genetically regulated genes from the Genotype-Tissue Expression project through a combination of multi-tissue transcriptome-wide association analyses and genetic colocalization. Mendelian randomization (MR) analyses also identified circulating proteins and metabolites causally associated with parental lifespan that may offer new drug repositioning opportunities for healthspan such as drugs targeting apolipoprotein-B-containing lipoproteins. Liver expression of HP, the gene encoding haptoglobin, and plasma haptoglobin levels were causally linked with parental lifespan. Phenome-wide MR analyses were used to map genetically regulated genes, proteins and metabolites with the disease-related phenome in the UK Biobank and FinnGen. Altogether, this study identified novel biological determinants of aging and potential therapeutic targets for human healthspan extension.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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