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Enregistrement W3041554972

Hypoxia and the metabolic phenotype of Daphnia

2020· dissertation· en· W3041554972 sur OpenAlexfundno aff
K. Westbury

Notice bibliographique

RevueQSpace (Queen's University Library) · 2020
Typedissertation
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueChemical Reactions and Isotopes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésHypoxia (environmental)PhenotypeDaphniaBiologyZoologyGeneticsChemistryGeneOxygenCrustacean
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental hypoxia is a phenomenon in which low oxygen conditions force organisms to respond behaviourally and physiologically to survive in an otherwise lethal habitat.Animals display different mechanisms to cope with the harsh living conditions of a hypoxic environment, most of which can be summarized as: (i) improvement of oxygen transport capacity, (ii) improvement of oxygen storage, and (iii) supply of energy via anaerobic metabolism.Daphnia respond to hypoxia by increasing the expression of extracellular hemoglobin (Hb), an oxygen transport/storage protein.It is generally thought that this upregulation is used as a strategy to sustain sufficient oxygenation to tissues, allowing Daphnia to stay systemically normoxic even when the environment is hypoxic.Although the changes/differences in Hb levels have been studied in many contexts, very little has been done exploring the basic properties of energy metabolism in Daphnia.My focus was on the link between the Hb response and the metabolic phenotype.I sampled different Daphnia species from 20 lakes in the Frontenac Arch Biosphere.The resulting metabolite analyses support the idea that the benefit of Hb is facilitating oxygen delivery rather than to increase oxygen storage.I found a distinct lack of coordination in the responses of the glycolytic enzymes relative to Hb. Daphnia pulicaria from four lakes appeared to demonstrate one of two strategies in relation to coordination of glycolytic genes and Hb.In some lakes D. pulicaria showed a pronounced induction of Hb without changes in glycolytic enzymes, whereas other lakes showed a blunted Hb response but pronounced glycolytic response.Serial sampling showed the Hb response early in the season (May-June) and a glycolytic response later in the season (September-October).Further studies should include transcriptome analyses exploring if lake-by-lake differences are due to microevolutionary variation or phenotypic responses to different degrees and durations of oxygen stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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