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Enregistrement W3041675387

The pro-cell death Bcl-2 family member, BNIP3 is mutated in breast tumors and this mutation increases resistance to hypoxia-induced cell death in breast cancer cell lines

2006· article· en· W3041675387 sur OpenAlexaffabout
Nicolle A. Bristow, Elizabeth S. Henson, Niki Vegh-Yarema, David D. Eisenstat, Spencer B. Gibson

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchProgrammed cell deathBreast cancerMissense mutationMutationNonsense mutationGeneMolecular biologyCancerApoptosisGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

4078 BNIP3 (Bcl-2/adenovirus E1B 19 kDa Interacting Protein) is a pro-cell death member of the Bcl-2 family of proteins. It has been shown that BNIP3 expression is increased in hypoxic regions of breast tumors. This increased expression is paradoxical since BNIP3 induces cell death, yet these tumor cells remain viable. One possible explanation is the presence of mutations in the BNIP3 gene leading to the inactivation of the BNIP3 protein. We have previously found that BNIP3 is over-expressed in brain glioblastoma multiforme (GBM) tumors and is mutated in 17% of these tumors inactivating its cell death function. Therefore, we are investigating whether mutations in the BNIP3 gene are present in breast tumors and whether these mutations block hypoxia-induced cell death. To determine whether BNIP3 is mutated in breast tumors, RNA is isolated from frozen high grade breast tumor sections from the Manitoba Breast Tumor Bank. Reverse-transcriptase PCR is performed and the resultant cDNA sequenced. Of the 17 tumors sequenced to date, four mutations have been found, including two nonsense mutations (single nucleotide insertions) and two missense mutations. These mutations were confirmed using a single nucleotide primer extension assay. Immuno-fluorescent staining for BNIP3 expression in breast tumors revealed BNIP3 expression in tumors where the BNIP3 gene is mutated. We also determined that the ovarian cancer cell line SkOv3 has a mutation in BNIP3 resulting in a truncated protein. To determine if the mutations detected in breast tumors affect BNIP3 protein function, the breast cancer cell line MCF-7 and the human embryonic cell line HEK293 were transfected with expression constructs containing wild type or mutant BNIP3 cDNA. The expression of mutant BNIP3 renders these cells more resistant to hypoxia-induced cell death compared to cells expressing empty vector or wild type BNIP3. Since BNIP3 induces cell death by localizing with the mitochondria, we evaluated the ability of mutant BNIP3 to localize to the mitochondria. We demonstrated that mutant BNIP3 localizes to the mitochondria. Ongoing studies will demonstrate whether breast cancer cells expressing mutant BNIP3 injected into nude mice form tumors faster than cells expressing empty vector. Overall, our results indicate that BNIP3 is mutated in breast tumors and these mutations render breast cancer cells resistant to hypoxia-induced cell death.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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