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Enregistrement W3041902060 · doi:10.1016/j.ebiom.2020.102860

Tumour budding, poorly differentiated clusters, and T-cell response in colorectal cancer

2020· article· en· W3041902060 sur OpenAlexfundno aff
Kenji Fujiyoshi, Juha P. Väyrynen, Jennifer Borowsky, David Papke, Kota Arima, Koichiro Haruki, Junko Kishikawa, Naohiko Akimoto, Tomotaka Ugai, Mai Chan Lau, Simeng Gu, Shanshan Shi, Melissa Zhao, Annacarolina Fabiana Lucia Da Silva, Tyler S. Twombly, Hongmei Nan, Jeffrey A. Meyerhardt, Mingyang Song, Xuehong Zhang, Kana Wu, Andrew T. Chan, Charles S. Fuchs, Jochen K. Lennerz, Marios Giannakis, Jonathan A. Nowak, Shuji Ogino

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institutes of HealthFaculty of Arts and SciencesGary Bennett Family FundBayer CorporationResearch Promotion FoundationMitsukoshi Health and Welfare FoundationColorectal Cancer AllianceConquer Cancer FoundationGeorge W. Stone Family FoundationTaiho PharmaceuticalEntertainment Industry FoundationStand Up To CancerUehara Memorial FoundationNational Cancer InstituteBayerGilead SciencesAmerican Association for Cancer ResearchEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbDana-Farber/Harvard Cancer CenterMerckDana-Farber Cancer InstitutePfizerCelgene
Mots-clésColorectal cancerBuddingBiologyCancer researchCancerMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Tumour budding and poorly differentiated clusters (PDC) represent forms of tumour invasion. We hypothesised that T-cell densities (reflecting adaptive anti-tumour immunity) might be inversely associated with tumour budding and PDC in colorectal carcinoma. METHODS: Utilising 915 colon and rectal carcinomas in two U.S.-wide prospective cohort studies, and multiplex immunofluorescence combined with machine learning algorithms, we assessed CD3, CD4, CD8, CD45RO (PTPRC), and FOXP3 co-expression patterns in lymphocytes. Tumour budding and PDC at invasive fronts were quantified by digital pathology and image analysis using the International tumour Budding Consensus Conference criteria. Using covariate data of 4,420 incident colorectal cancer cases, inverse probability weighting (IPW) was integrated with multivariable logistic regression analysis that assessed the association of T-cell subset densities with tumour budding and PDC while adjusting for selection bias due to tissue availability and potential confounders, including microsatellite instability status. FINDINGS: < 0.001) in Cox regression analysis. There were no significant associations of PDC with T-cell subsets. INTERPRETATION: Tumour epithelial naïve and memory cytotoxic T cell densities are inversely associated with tumour budding at invasive fronts, suggesting that cytotoxic anti-tumour immunity suppresses tumour microinvasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,831
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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