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Enregistrement W3042683428

A PCR/LDR-Based Functional Molecular Marker of Rice ( Oryza Sativa L. ) Aroma Allele BADH2-E2

2020· article· en· W3042683428 sur OpenAlexvenueno aff
Huangwei Chu, Can Cheng, Rongjian Tu, Jihua Zhou, Fuan Niu, Bin Sun, Yao Li, Yao Yao, Yi‐Wen Huang, Zhongyong Luo, Liming Cao

Notice bibliographique

RevueRice Genomics and Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGABA and Rice Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOryza sativaBiologyMolecular markerAlleleAromatic riceLocus (genetics)PopulationAromaGenotypeGenetic markerMolecular biologyGeneticsGeneFood scienceMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The loss-of-function of betaine aldehyde dehydrogenase 2 (BADH2) in rice leading to the accumulation of 2-acetyl-1-pyrrolidine (2AP), the substrate of enzymatic reaction , makes the rice flavor. The rice aroma allele BADH2-E2 has been widely used in aroma rice breeding in China. In this study, a PCR/LDR-based functional molecular marker was developed according to the 7bp deletion in the second exon of badH2-E2 aroma allele. Using PCR/LDR-based markers, the genotypes of Shenfan24, Shenfan26 and their F1 hybrids in the badH2-E2 locus could be accurately identified, and screening the F2 population derived from the cross of Shenfan24 and Shenfan26 shows that the segregation ratio of badH2-E2 positive homozygous, heterozygous and badH2-E2 negative homozygous were 1:2:1. The results of this study provide a new type of molecular marker for marker-assisted breeding and have certain application potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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