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Enregistrement W3043220890 · doi:10.3389/fgene.2020.00636

Poly(A) Binding Protein Is Required for Nuclear Localization of the Ecdysteroidogenic Transcription Factor Molting Defective in the Prothoracic Gland of Drosophila melanogaster

2020· article· en· W3043220890 sur OpenAlexfundno aff
Takumi Kamiyama, Wei Sun, Naoki Tani, Akira Nakamura, Ryusuke Niwa

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyInstitute of GeneticsJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésProthoracic glandBiologyTranscription factorEcdysoneDrosophila melanogasterRNA interferenceCell biologyZinc finger transcription factorTranscriptional regulationRegulation of gene expressionRepressorEcdysone receptorZinc fingerTranscription (linguistics)Molecular biologyNuclear receptorGeneGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Steroid hormone signaling contributes to the development of multicellular organisms. In insects, ecdysteroids, like ecdysone and the more biologically-active derivative 20-hydroxyecdysone (20E), promote molting and metamorphosis. Ecdysone is biosynthesized in the prothoracic gland (PG), via several steps catalyzed by ecdysteroidogenic enzymes that are encoded by Halloween genes. The spatio-temporal expression pattern of ecdysteroidogenic genes is strictly controlled, resulting in a proper fluctuation of the 20E titer during insect development. However, their transcriptional regulatory mechanism is still elusive. A previous study has found that the polyadenylated tail (poly(A)) deadenylation complex, called Carbon catabolite repressor 4-Negative on TATA (CCR4-NOT) regulates the expression of spookier (spok), which encodes one of the ecdysteroidogenic enzymes in the fruit fly Drosophila melanogaster. Based on this finding, we speculated whether any other poly(A)-related protein also regulates spok expression. In this study, we reported that Poly(A) binding protein (Pabp) is involved in spok expression by regulating nuclear localization of the transcription factor Molting defective (Mld). When pabp was knocked down specifically in the PG by transgenic RNAi, both spok mRNA and Spok protein levels were significantly reduced. In addition, the spok promoter-driven GFP signal was also reduced in the pabp-RNAi PG, suggesting that Pabp is involved in the transcriptional regulation of spok. We next examined which transcription factors are responsible for Pabp-dependent transcriptional regulation. Among the transcription factors acting in the PG, we primarily focused on the zinc-finger transcription factor Mld, as Mld is essential for spok transcription. Mld was localized in the nucleus of the control PG cells, while Mld abnormally accumulated in the cytoplasm of pabp-RNAi PG cells. In contrast, pabp-RNAi did not affect the nuclear localization of other transcription factors, including Ventral vein lacking and Pou domain motif 3, in PG cells. From these results, we propose that Pabp regulates subcellular localization in the PG specifically of the transcription factor Mld, in the context of ecdysone biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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