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Enregistrement W3043233900 · doi:10.1101/2020.07.10.20142679

The Canadian ALS Neuroimaging Consortium (CALSNIC) - a multicentre platform for standardized imaging and clinical studies in ALS

2020· preprint· en· W3043233900 sur OpenAlexaffabout
Sanjay Kalra, Muhammad Haris Khan, Laura Barlow, Christian Beaulieu, Michael Benatar, Hannah Briemberg, Sneha Chenji, Míriam Garrido Clua, Sumit Das, Annie Dionne, Nicolas Dupré, Derek Emery, Dean T. Eurich, Richard Frayne, Angela Genge, Summer Gibson, Simon J. Graham, Christopher C. Hanstock, Abdullah Ishaque, Jeffrey T. Joseph, Julia Keith, Lawrence Korngut, Dennell Krebs, Cheryl R. McCreary, Pradip Pattany, Peter Seres, Christen Shoesmith, Trevor Szekeres, Fred Tam, Robert C. Welsh, Alan H. Wilman, Yee‐Hong Yang, Yana Yunusova, Lorne Zinman

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of TorontoUniversity of AlbertaUniversité LavalUniversity of CalgaryMcGill UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroimagingAmyotrophic lateral sclerosisMedicineNeuropsychologyMagnetic resonance imagingPopulationDiseaseMedical physicsPathologyPsychiatryCognitionRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a disabling and rapidly progressive neurodegenerative disorder. Increasing age is an important risk factor for developing ALS, thus the societal impact of this devastating disease will become more profound as the population ages. A significant hurdle to finding effective treatment has been an inability to accurately quantify cerebral degeneration associated with ALS in humans. Advanced magnetic resonance imaging (MRI) techniques hold promise in providing a set of biomarkers to assist in aiding diagnosis and in efficiently evaluating new drugs to treat ALS. Methods The Canadian ALS Neuroimaging Consortium (CALSNIC) was founded to develop and evaluate advanced MRI-based biomarkers that delineate biological heterogeneity, track disease progression, and predict survival in a large and heterogeneous sample of ALS patients. Findings CALSNIC has launched two studies to date (CALSINC-1, CALSNIC-2), acquiring multimodal neuroimaging, neurological, neuropsychological data, and neuropathological data from ALS patients and healthy controls in a prospective and longitudinal fashion from multiple centres in Canada and, more recently, the United States. Clinical and MRI protocols are harmonized across research centres and different MR vendors. Interpretation CALSNIC provides a multicentre platform for studying ALS biology and developing MRI-based biomarkers. Funding Canadian Institutes of Health Research, ALS Society of Canada, Brain Canada Foundation, Shelly Mrkonjic Research Fund

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,073
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,055
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil0,527

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0730,055
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,009
Études des sciences et des technologies0,0050,003
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0050,009
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,200
Tête enseignante GPT0,449
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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