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Enregistrement W3044055937 · doi:10.1088/1361-6560/aba8b3

Cost-function testing methodology for image-based registration of endoscopy to CT images in the head and neck

2020· article· en· W3044055937 sur OpenAlexafffund
Runjie Bill Shi, Souzan Mirza, Diego Martínez Plasencia, Catriona M. Douglas, John Y. N. Cho, Jonathon C. Irish, David A. Jaffray, Robert Weersink

Notice bibliographique

RevuePhysics in Medicine and Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Radiotherapy Techniques
Établissements canadiensUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFiducial markerComputer visionContouringArtificial intelligenceImage registrationComputer scienceGround truthMedical imagingMutual informationImage (mathematics)Computer graphics (images)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the largest geometric uncertainties in designing radiotherapy treatment plans for squamous cell cancers of the head and neck is contouring the gross tumor volume. We have previously described a method of projecting mucosal disease contours, visible on endoscopy, to volumetrically reconstructed planning computed tomography (CT) datasets, using electromagnetic (EM) tracking of a flexible endoscope, enabling rigid registration between endoscopic and CT images.However, to achieve better accuracy for radiotherapy planning, we propose refining this initial registration with image-based registration methods. In this paper, several types of cost functions are evaluated based on accuracy and robustness. Three phantoms and eight clinical cases are used to test each cost function, with initial registration of endoscopy to CT provided by the pose of the flexible endoscope recovered from EM tracking. Cost function classes include: cross correlation, mutual information and gradient methods. For each test case, a ground truth virtual camera pose was first defined by manual registration of anatomical features visible in both real and virtual endoscope images. A new set of evenly spaced fiducial points and a sample contour were created and projected onto the CT image to be used in assessing image registration quality. A new set of 5000 displaced poses was generated by random sampling displacements along each translational and rotational dimension. At each pose, fiducial and contour points in the real image were again projected on the CT image. The cost function, fiducial registration error and contouring error values were then calculated.While all cost functions performed well in select cases, only the normalized gradient field function consistently had registration errors less than 2 mm, which is the accuracy needed if this application of registering mucosal disease identified on optical image to CT images is to be used in the clinical practice of radiation treatment planning.(Registration: ClinicalTrials.gov NCT02704169).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,373
Tête enseignante GPT0,473
Écart entre enseignants0,101 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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