Frequency of the loss of CAA interruption in the HTT CAG tract and implications for Huntington disease in the reduced penetrance range
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: In some Huntington disease (HD) patients, the "loss of interruption" (LOI) variant eliminates an interrupting codon in the HTT CAG-repeat tract, which causes earlier age of onset (AOO). The magnitude of this effect is uncertain, since previous studies included few LOI carriers, and the variant also causes CAG size misestimation. We developed a rapid LOI detection screen, enabling unbiased frequency estimation among manifest HD patients. Additionally, we combined published data with clinical data from newly identified patients to accurately characterize the LOI's effect on AOO. METHODS: We developed a LOI detection polymerase chain reaction (PCR) assay, and screened patients to estimate the frequency of the LOI variant and its effect on AOO. RESULTS: Mean onset for LOI carriers (n = 49) is 20.4 years earlier than expected based on diagnosed CAG size. After correcting for CAG size underestimation, the variant is still associated with onset 9.5 years earlier. The LOI is present in 1.02% of symptomatic HD patients, and in 32.2% of symptomatic reduced penetrance (RP) range patients (36-39 CAGs). CONCLUSION: The LOI causes significantly earlier onset, greater than expected by CAG length, particularly in persons with 36-39 CAG repeats. Detection of this variant has implications for HD families, especially for those in the RP range.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».