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Enregistrement W3046964403 · doi:10.1158/1538-7445.pedca19-a41

Abstract A41: Novel mithramycin analogues with improved pharmacologic profile and efficacy in ETS transcription factor-driven tumors

2020· article· en· W3046964403 sur OpenAlexaboutno aff
Markos Leggas, Joseph M. Eckenrode, Yang Liu, Abhisek Mandal, Reiya Hayden, Oleg V. Tsodikov, Jon S. Thorson, Jurgen Rorh

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésETS transcription factor familyFLI1Transcription factorBiologyCancer researchChromosomal translocationCarcinogenesisFusion geneGene silencingSarcomaPromoterGeneMolecular biologyGene expressionGeneticsMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Chromosomal translocations of ETS family transcription factors (TF) are found in Ewing sarcoma, prostate cancer, and leukemia and lead to expression of aberrant ETS transcription factors driving tumorigenesis. Mithramycin (MTM) inhibits EWS-FLI1, the most common ETS-related TFs in Ewing sarcoma through interference at its DNA binding sites on promoters. However, MTM has a narrow therapeutic window marked by severe liver and hematologic toxicities and poor pharmacokinetic (PK) properties, as demonstrated recently in a pediatric clinical trial with Ewing sarcoma patients. Here, we sought to develop analogues with specificity toward ETS family TFs and improved pharmacologic properties. Methods: Guided by crystal structures of MTM/DNA/ETS, we used semisynthetic approaches to prepare a library of analogs by substitution on the 3-side chain of MTM-SA and MTM (analogs). To select analogs with specific activity toward cells with ETS-related chromosomal translocations, analog cytotoxicity was determined in TC32 cells before and after EWS-FLI1 silencing. To confirm selectivity, analogs were tested in a panel of Ewing sarcoma cell lines (n=8) expressing EWS-ETS translocations and compared to a panel of non-Ewing cell lines (n=9) that do not express these translocations. CETSA, FRET, and luciferase reporter assays were used to evaluate interactions with EWS-FLI1 and SP1 proteins and gene promoter regions they bind. Inhibition of select transcriptionally regulated genes was determined by qRT-PCR and immunoblotting. Select analogs were tested in vivo to assess PK in mice and primates, identify the maximum tolerated dose (MTD), and determine dose-dependent efficacy in mouse xenograft models. Results: MTM analogs had higher GI50 in silenced EWS-FLI1 cells and > 10-fold lower GI50 in ETS-dependent cell lines vs. non-ETS dependent cancer cells, as compared to ~3-fold for MTM. Target engagement was demonstrated in dose-dependent manner using a luciferase reporter TC32 cell line under control of the NR0B1 promoter, which is regulated by EWS-FLI1, and CETSA experiments showed increased physical interaction of the analogs with EWS-FLI1 as compared to MTM. Treatment with MTM and analogs produced comparable dose-dependent displacement of an ETS DNA binding domain from GGAA (microsatellite-like) DNA fragments as demonstrated by FRET. Exposure to analogs led to concentration-dependent downregulation of EWS-FLI1 and Sp1 regulated genes. In vivo studies showed that MTM analogs attained higher exposure at their respective MTD and had lower clearance in mice and primates. Unlike MTM, analogs reversed tumor growth and increased survival at the MTD and 2/3 of MTD. Conclusion: We demonstrated that MTM analogs are selectively more cytotoxic in tumor cell lines dependent on ETS family TFs and have vastly improved PK properties as confirmed in a primate model. Given their effectiveness at 2/3 of the MTD, they are expected to have an improved therapeutic window. Citation Format: Markos Leggas, Joseph Eckenrode, Yang Liu, Abhisek Mandal, Reiya Hayden, Oleg Tsodikov, Jon Thorson, Jurgen Rorh. Novel mithramycin analogues with improved pharmacologic profile and efficacy in ETS transcription factor-driven tumors [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on the Advances in Pediatric Cancer Research; 2019 Sep 17-20; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(14 Suppl):Abstract nr A41.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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