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Enregistrement W3048637915 · doi:10.1093/glycob/cwaa075

O-linked mucin-type glycosylation regulates the transcriptional programme downstream of EGFR

2020· article· en· W3048637915 sur OpenAlexfundno aff
Virginia Tajadura‐Ortega, Gennaro Gambardella, Alexandra Skinner, Adnan Halim, Julie Van Coillie, Katrine Ter-Borch Gram Schjoldager, Richard Beatson, Rosalind Graham, Daniela Achkova, Joyce Taylor‐Papadimitriou, Francesca D. Ciccarelli, Joy Burchell

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNovo Nordisk FondenMedical Research Council CanadaCancer Research UK
Mots-clésGlycosylationMucinDownstream (manufacturing)ChemistryCell biologyN-linked glycosylationGlycoproteinBiologyBiochemistryGlycanBusiness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aberrant mucin-type O-linked glycosylation is a common occurrence in cancer where the upregulation of sialyltransferases is often seen leading to the early termination of O-glycan chains. Mucin-type O-linked glycosylation is not limited to mucins and occurs on many cell surface glycoproteins including EGFR, where the number of sites can be limited. Upon EGF ligation, EGFR induces a signaling cascade and may also translocate to the nucleus where it directly regulates gene transcription, a process modulated by Galectin-3 and MUC1 in some cancers. Here, we show that upon EGF binding, breast cancer cells carrying different O-glycans respond by transcribing different gene expression signatures. MMP10, the principal gene upregulated when cells carrying sialylated core 1 glycans were stimulated with EGF, is also upregulated in ER-positive breast carcinoma reported to express high levels of ST3Gal1 and hence mainly core 1 sialylated O-glycans. In contrast, isogenic cells engineered to carry core 2 glycans upregulate CX3CL1 and FGFBP1 and these genes are upregulated in ER-negative breast carcinomas, also known to express longer core 2 O-glycans. Changes in O-glycosylation did not significantly alter signal transduction downstream of EGFR in core 1 or core 2 O-glycan expressing cells. However, striking changes were observed in the formation of an EGFR/galectin-3/MUC1/β-catenin complex at the cell surface that is present in cells carrying short core 1-based O-glycans but absent in core 2 carrying cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,539
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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