MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3048837274 · doi:10.1111/bph.15223

Pharmacological properties of TRPM3 isoforms are determined by the length of the pore loop

2020· article· en· W3048837274 sur OpenAlexafffund
Katharina Held, Vincenzo Davide Aloi, Ana Cristina Nogueira Freitas, Annelies Janssens, Andrei Segal, Julia Przibilla, Stephan Philipp, Yu Tian Wang, Thomas Voets, Joris Vriens

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Pharmacology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFondation Médicale Reine ElisabethFondation contre le CancerFonds Wetenschappelijk OnderzoekStichting Tegen KankerVancouver Coastal Health Research InstituteQueen Elisabeth Medical FoundationUniversität des SaarlandesMichael Smith Health Research BCVlaamse regeringKU LeuvenBelgische Federale OverheidsdienstenAustralian Government
Mots-clésBiophysicsTransient receptor potential channelGatingChemistryAlternative splicingGene isoformMutagenesisReceptorMutantBiochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Transient receptor potential melastatin 3 (TRPM3) is a non-selective cation channel that plays a pivotal role in the peripheral nervous system as a transducer of painful heat signals. Alternative splicing gives rise to several TRPM3 variants. The functional consequences of these splice isoforms are poorly understood. Here, the pharmacological properties of TRPM3 variants arising from alternative splicing in the pore-forming region were compared. EXPERIMENTAL APPROACH: Calcium microfluorimetry and patch clamp recordings were used to compare the properties of heterologously expressed TRPM3α1 (long pore variant) and TRPM3α2-α6 (short pore variants). Furthermore, site-directed mutagenesis was done to investigate the influence of the length of the pore loop on the channel function. KEY RESULTS: All short pore loop TRPM3α variants (TRPM3α2-α6) were activated by the neurosteroid pregnenolone sulphate (PS) and by nifedipine, whereas the long pore loop variant TRPM3α1 was insensitive to either compound. In contrast, TRPM3α1 was robustly activated by clotrimazole, a compound that does not directly activate the short pore variants but potentiates their responses to PS. Clotrimazole-activated TRPM3α1 currents were largely insensitive to established TRPM3α2 antagonists and were only partially inhibited upon activation of the μ opioid receptor. Finally, by creating a set of mutant channels with pore loops of intermediate length, we showed that the length of the pore loop dictates differential channel activation by PS and clotrimazole. CONCLUSION AND IMPLICATIONS: Alternative splicing in the pore-forming region of TRPM3 defines the channel's pharmacological properties, which depend critically on the length of the pore-forming loop. LINKED ARTICLES: This article is part of a themed issue on Structure Guided Pharmacology of Membrane Proteins (BJP 75th Anniversary). To view the other articles in this section visit http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/bph.v179.14/issuetoc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,464

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBritish Journal of PharmacologyMême sujetIon Channels and ReceptorsTravaux en français237 207