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Enregistrement W3049139822 · doi:10.1038/s41467-020-17917-8

Genomic characterization of malignant progression in neoplastic pancreatic cysts

2020· article· en· W3049139822 sur OpenAlexaff
Michaël Noë, Noushin Niknafs, Catherine G. Fischer, Wenzel M. Hackeng, Violeta Beleva Guthrie, Waki Hosoda, Marija Debeljak, Eniko Papp, Vilmos Adleff, James R. White, Claudio Luchini, Antonio Pea, Aldo Scarpa, Giovanni Butturini, Giuseppe Zamboni, M. Paola Castelli, Seung‐Mo Hong, Shinichi Yachida, Nobuyoshi Hiraoka, Anthony J. Gill, Jaswinder S. Samra, G. Johan A. Offerhaus, Anne Hoorens, Joanne Verheij, Casper Jansen, Volkan Adsay, Wei Jiang, Jordan M. Winter, Jorge Albores‐Saavedra, Benoît Terris, Elizabeth D. Thompson, Nicholas J. Roberts, Ralph H. Hruban, Rachel Karchin, Robert B. Scharpf, Lodewijk A.A. Brosens, Victor E. Velculescu, Laura D. Wood

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesPanKind, The Australian Pancreatic Cancer FoundationLisa Waller Hayes FoundationEmerson CollectiveNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthIncyteRolfe Pancreatic Cancer FoundationGerald O. Mann Charitable FoundationNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSidney Kimmel Foundation for Cancer ResearchDr. Miriam and Sheldon G. Adelson Medical Research Foundation
Mots-clésDysplasiaPancreatic cancerIntraductal papillary mucinous neoplasmBiologyExome sequencingMalignant transformationPathologyAdenocarcinomaCancerCancer researchPancreasMedicineMutationGeneGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intraductal papillary mucinous neoplasms (IPMNs) and mucinous cystic neoplasms (MCNs) are non-invasive neoplasms that are often observed in association with invasive pancreatic cancers, but their origins and evolutionary relationships are poorly understood. In this study, we analyze 148 samples from IPMNs, MCNs, and small associated invasive carcinomas from 18 patients using whole exome or targeted sequencing. Using evolutionary analyses, we establish that both IPMNs and MCNs are direct precursors to pancreatic cancer. Mutations in SMAD4 and TGFBR2 are frequently restricted to invasive carcinoma, while RNF43 alterations are largely in non-invasive lesions. Genomic analyses suggest an average window of over three years between the development of high-grade dysplasia and pancreatic cancer. Taken together, these data establish non-invasive IPMNs and MCNs as origins of invasive pancreatic cancer, identifying potential drivers of invasion, highlighting the complex clonal dynamics prior to malignant transformation, and providing opportunities for early detection and intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,260
Score d'incertitude au seuil0,283

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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