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Enregistrement W3049246633 · doi:10.1111/brv.12641

Next‐generation biological control: the need for integrating genetics and genomics

2020· review· en· W3049246633 sur OpenAlexaff
Kelley Leung, Erica Ras, Kim Ferguson, Simone Ariëns, D. Babendreier, Piter Bijma, Jacques Brodeur, Margreet A. Bruins, Alejandra Centurión, Sophie Chattington, Milena Chinchilla-Ramírez, Marcel Dicke, Nina E. Fatouros, Joel González‐Cabrera, Thomas Groot, Tim Haye, Markus Knapp, Panagiota Koskinioti, Sophie Le Hesran, Manolis Lyrakis, Angeliki Paspati, Meritxell Pérez‐Hedo, Wouter N. Plouvier, Christian Schlötterer, Judith M. Stahl, Andra Thiel, Alberto Urbaneja, Louis van de Zande, Eveline C. Verhulst, L.E.M. Vet, S.L. Visser, John H. Werren, Shuwen Xia, Bas J. Zwaan, Sara Magalhães, Leo W. Beukeboom, Bart A. Pannebakker

Notice bibliographique

RevueBiological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society · 2020
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsEuropean Commission
Mots-clésBiologyContext (archaeology)GenomicsBiotechnologySelection (genetic algorithm)Computational biologyTraitGenomeGeneticsComputer scienceGeneArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biological control is widely successful at controlling pests, but effective biocontrol agents are now more difficult to import from countries of origin due to more restrictive international trade laws (the Nagoya Protocol). Coupled with increasing demand, the efficacy of existing and new biocontrol agents needs to be improved with genetic and genomic approaches. Although they have been underutilised in the past, application of genetic and genomic techniques is becoming more feasible from both technological and economic perspectives. We review current methods and provide a framework for using them. First, it is necessary to identify which biocontrol trait to select and in what direction. Next, the genes or markers linked to these traits need be determined, including how to implement this information into a selective breeding program. Choosing a trait can be assisted by modelling to account for the proper agro-ecological context, and by knowing which traits have sufficiently high heritability values. We provide guidelines for designing genomic strategies in biocontrol programs, which depend on the organism, budget, and desired objective. Genomic approaches start with genome sequencing and assembly. We provide a guide for deciding the most successful sequencing strategy for biocontrol agents. Gene discovery involves quantitative trait loci analyses, transcriptomic and proteomic studies, and gene editing. Improving biocontrol practices includes marker-assisted selection, genomic selection and microbiome manipulation of biocontrol agents, and monitoring for genetic variation during rearing and post-release. We conclude by identifying the most promising applications of genetic and genomic methods to improve biological control efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,006
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,280
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,046 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations151
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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