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Enregistrement W3049374360 · doi:10.1161/circgen.120.002919

Polygenic Contribution to Low-Density Lipoprotein Cholesterol Levels and Cardiovascular Risk in Monogenic Familial Hypercholesterolemia

2020· article· en· W3049374360 sur OpenAlexaff
Mark Trinder, Martine Paquette, Lubomira Cermakova, Matthew R. Ban, Robert A. Hegele, Alexis Baass, Liam R. Brunham

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensWestern UniversitySt. Paul's HospitalMontreal Clinical Research InstituteMcGill UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésMedicineInternal medicineFamilial hypercholesterolemiaHazard ratioCohortAtherosclerotic cardiovascular diseaseMyocardial infarctionBiobankPCSK9Framingham Risk ScoreProportional hazards modelCardiologyCholesterolEndocrinologyLipoproteinDiseaseLDL receptorConfidence intervalBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Familial hypercholesterolemia (FH) is a common autosomal codominant genetic disorder, which causes elevated levels of low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) and increased risk of premature atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD). Even among individuals with monogenic FH, there is substantial interindividual variability in LDL-C levels and risk of ASCVD. We assessed the influence of an LDL-C polygenic score on levels of LDL-C and risk of ASCVD for individuals with monogenic FH. Methods: We constructed a weighted LDL-C polygenic score, composed of 28 single-nucleotide variants, for individuals with monogenic FH from the British Columbia FH (n=262); Nutrition, Metabolism and Atherosclerosis Clinic (n=552); and UK Biobank cohorts (n=306). We assessed the association between LDL-C polygenic score with LDL-C levels and ASCVD risk using linear regression and Cox-proportional hazard models, respectively. ASCVD was defined as myocardial infarction, coronary or carotid revascularization, transient ischemic attack, or stroke. The results from individual cohorts were combined in fixed-effect meta-analyses. Results: Levels of LDL-C were significantly associated with LDL-C polygenic score in the Nutrition, Metabolism and Atherosclerosis Clinic cohort, UK Biobank cohort, and in the meta-analysis (β [95% CI]=0.13 [0.072–0.19] per a 20% increase in LDL-C polygenic score percentile, P <0.0001). Additionally, an elevated LDL-C polygenic score (≥80th percentile) was associated with a trend towards increased ASCVD risk in all 3 cohorts individually. This association was statistically significant in the meta-analysis (hazard ratio [95% CI]=1.48 [1.02–2.14], P =0.04). Conclusions: Polygenic contributions to LDL-C explain some of the heterogeneity in clinical presentation and ASCVD risk for individuals with FH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,007
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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