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Enregistrement W3049662122 · doi:10.1186/s12986-020-00487-3

Early leucine programming on protein utilization and mTOR signaling by DNA methylation in zebrafish (Danio rerio)

2020· article· en· W3049662122 sur OpenAlexaff
Qiang-Sheng Zhu, Jie Wang, Shan He, Xu‐Fang Liang, Shuang Xie, Qianqian Xiao

Notice bibliographique

RevueNutrition & Metabolism · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle metabolism and nutrition
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaHuazhong Agricultural UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésZebrafishBiologyDNA methylationPI3K/AKT/mTOR pathwayEpigeneticsMethylationLeucineDanioSignal transductionCell biologyAmino acidBiochemistryGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Early nutritional programming affects a series of metabolism, growth and development in mammals. Fish also exhibit the developmental plasticity by early nutritional programming. However, little is known about the effect of early amino acid programming on growth and metabolism. Methods In the present study, zebrafish ( Danio rerio ) was used as the experimental animal to study whether early leucine stimulation can programmatically affect the mechanistic target of rapamycin (mTOR) signaling pathway, growth and metabolism in the later life, and to undercover the mechanism of epigenetic regulation. Zebrafish larvas at 3 days post hatching (dph) were raised with 1.0% leucine from 3 to 13 dph during the critical developmental stage, then back to normal water for 70 days (83 dph). Results The growth performance and crude protein content of zebrafish in the early leucine programming group were increased, and consistent with the activation of the mTOR signaling pathway and the high expression of genes involved in the metabolism of amino acid and glycolipid. Furthermore, we compared the DNA methylation profiles between the control and leucine-stimulated zebrafish, and found that the methylation levels of CG-differentially methylated regions (DMGs) and CHH-DMGs of genes involved in mTOR signaling pathway were different between the two groups. With quantitative PCR analysis, the decreased methylation levels of CG type of Growth factor receptor-bound protein 10 ( Grb10 ), eukaryotic translation initiation factor 4E ( eIF4E ) and mTOR genes of mTOR signaling pathway in the leucine programming group, might contribute to the enhanced gene expression. Conclusions The early leucine programming could improve the protein synthesis and growth, which might be attributed to the methylation of genes in mTOR pathway and the expression of genes involved in protein synthesis and glycolipid metabolism in zebrafish. These results could be beneficial for better understanding of the epigenetic regulatory mechanism of early nutritional programming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,128
Score d'incertitude au seuil0,878

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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