MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3057625252 · doi:10.1016/j.celrep.2020.108037

Affinity for the Interface Underpins Potency of Antibodies Operating In Membrane Environments

2020· article· en· W3057625252 sur OpenAlexafffund
Edurne Rujas, Sara Insausti, Daniel P. Leaman, Pablo Carravilla, Saul González-Resines, Valérie Monceaux, Rubén Sánchez‐Eugenia, Miguel García‐Porras, Ibón Iloro, Lei Zhang, Félix Elortza, Jean‐Philippe Julien, Asier Sáez‐Cirión, Michael B. Zwick, Christian Eggeling, Akio Ojida, Cármen Domene, José M. M. Caaveiro, José L. Nieva

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilEuropean CommissionEuskal Herriko UnibertsitateaCanada Research ChairsEusko JaurlaritzaDeutsche ForschungsgemeinschaftWolfson FoundationJapan Agency for Medical Research and DevelopmentJapan Society for the Promotion of ScienceJames B. Pendleton Charitable TrustMinisterio de Ciencia e InnovaciónWellcome Trust
Mots-clésEpitopeMembraneAntibodyChemistryGlycoproteinMolecular recognitionBiophysicsAntigenMembrane proteinHuman immunodeficiency virus (HIV)Cell membraneLipid bilayerCell biologyVirologyBiochemistryBiologyMoleculeImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The contribution of membrane interfacial interactions to recognition of membrane-embedded antigens by antibodies is currently unclear. This report demonstrates the optimization of this type of antibodies via chemical modification of regions near the membrane but not directly involved in the recognition of the epitope. Using the HIV-1 antibody 10E8 as a model, linear and polycyclic synthetic aromatic compounds are introduced at selected sites. Molecular dynamics simulations predict the favorable interactions of these synthetic compounds with the viral lipid membrane, where the epitope of the HIV-1 glycoprotein Env is located. Chemical modification of 10E8 with aromatic acetamides facilitates the productive and specific recognition of the native antigen, partially buried in the crowded environment of the viral membrane, resulting in a dramatic increase of its capacity to block viral infection. These observations support the harnessing of interfacial affinity through site-selective chemical modification to optimize the function of antibodies that target membrane-proximal epitopes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,204

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCell ReportsMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207