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Enregistrement W3065630765 · doi:10.1089/ind.2019.0023

Heterologous Expression of <i>Vitreoscilla</i> Hemoglobin in <i>Pseudomonas putida</i> KT2440 for the Production of <i>mcl</i> -PHA in Carbon-Limited Fermentations

2020· article· en· W3065630765 sur OpenAlexaff
Guilherme Henrique Duarte de Oliveira, A. Schneider, Minh Tri Vo, Juliana A. Ramsay, B. Ramsay

Notice bibliographique

RevueIndustrial Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas putidaPlasmidBiologyHeterologousEscherichia coliRecombinant DNAHeterologous expressionPolyhydroxyalkanoatesOverproductionFermentationMetabolic engineeringPseudomonasMicrobiologyBiochemistryBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The heterologous expression of Vitreoscilla hemoglobin (VHb) is known to enhance short-chain-length (scl) and short-chain-length-medium-chain-length (scl-mcl) polyhydroxyalkanoate (PHA) production in Escherichia coli, Aeromonas hydrophila and Pseudomonas putida, but has not been evaluated for the production of medium-chain-length (mcl) PHA in pseudomonads. Three recombinant strains of P. putida KT2440 were constructed, harboring pBBR1MCS-2 expression plasmids containing 0, 1 and 2 copies of the vgb gene. The vgb gene was placed under the control of the lac promoter, which conferred constitutive expression of vgb, since no lac repressor was produced. Mcl-PHA production was assessed in nonanoic acid-limited, fed-batch fermentations with exponential feeding. Although the VHb levels in the engineered strains were comparable to those observed in vgb-bearing pseudomonads, the recombinant strains had lower biomass production, PHA accumulation, volumetric productivity and product yield when compared to the wild-type strain. The performance of the plasmid-harboring strains decreased with increasing vgb copy numbers, presumably due to an increased metabolic burden arising from plasmid expression. All the fermentations ended at similar times due to insufficient oxygen supply and subsequent uncontrollable foaming, demonstrating that VHb production did not alleviate oxygen limitation. These results indicate that the effectiveness of VHb engineering must be assessed on a case-by-case basis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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