Locating the binding sites of two aminobenzoic acid derivatives on tRNA: drug binding efficacy and RNA structure
Notice bibliographique
Résumé
The binding of tRNA to aminobenzoic acid derivatives DAB-0 (N'-[4-(2,5-dioxo-pyrrolidin-1-yl)-benzoyl]-hydrazine carboxylic acid tert-butyl ester) and DAB-1 (N'-[4-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-yl)-benzoyl]-hydrazine carboxylic acid tert-butyl ester) was investigated in aqueous solution at physiological pH. Thermodynamic parameters ΔH0 −4.8 to −4.30 (kJ mol−1), ΔS0 24.20 to 22 (J mol−1K–1) and ΔG0 −12 to −11.40 (kJ mol−1) showed that DAB-0 and DAB-1 readily bind tRNA via ionic interactions with DAB-1 forming stronger tRNA adducts. Similar binding sites to A-T and G-C bases were located with DAB-0 and DAB-1. The binding efficacy ranged from 40% to 50%. No alteration of tRNA conformation was detected upon drug complexation. Communicated by Ramaswamy H. Sarma
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».