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Enregistrement W3080147306 · doi:10.1093/noajnl/vdaa103

Clinical and molecular characterization of a multi-institutional cohort of pediatric spinal cord low-grade gliomas

2020· article· en· W3080147306 sur OpenAlex
Sydney Grob, Liana Nobre, Kristen Campbell, Kurtis D. Davies, Scott Ryall, Dara L. Aisner, Lindsey M. Hoffman, Shadi Zahedi, Andrew Morin, Michele Crespo, Anandani Nellan, Adam L. Green, Nicholas K. Foreman, Rajeev Vibhakar, Todd C. Hankinson, Michael H. Handler, Cynthia Hawkins, Uri Tabori, Bette K. Kleinschmidt‐DeMasters, Jean M. Mulcahy Levy

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Neurological Disorders and StrokeBrain Tumour CharityNational Institutes of HealthMorgan Adams Foundation
Mots-clésCDKN2AFluorescence in situ hybridizationMedicineInterquartile rangeFusion geneOncologyPDGFRAPathologyCancer researchCohortInternal medicineGeneBiologyCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The mitogen-activated protein kinases/extracelluar signal-regulated kinases pathway is involved in cell growth and proliferation, and mutations in BRAF have made it an oncogene of interest in pediatric cancer. Previous studies found that BRAF mutations as well as KIAA1549–BRAF fusions are common in intracranial low-grade gliomas (LGGs). Fewer studies have tested for the presence of these genetic changes in spinal LGGs. The aim of this study was to better understand the prevalence of BRAF and other genetic aberrations in spinal LGG. Methods We retrospectively analyzed 46 spinal gliomas from patients aged 1–25 years from Children’s Hospital Colorado (CHCO) and The Hospital for Sick Children (SickKids). CHCO utilized a 67-gene panel that assessed BRAF and additionally screened for other possible genetic abnormalities of interest. At SickKids, BRAFV600E was assessed by droplet digital polymerase chain reaction and immunohistochemistry. BRAF fusions were detected by fluorescence in situ hybridization, reverse transcription polymerase chain reaction, or NanoString platform. Data were correlated with clinical information. Results Of 31 samples with complete fusion analysis, 13 (42%) harbored KIAA1549–BRAF. All 13 (100%) patients with confirmed KIAA1549–BRAF survived the entirety of the study period (median [interquartile range] follow-up time: 47 months [27–85 months]) and 15 (83.3%) fusion-negative patients survived (follow-up time: 37.5 months [19.8–69.5 months]). Other mutations of interest were also identified in this patient cohort including BRAFV600E, PTPN11, H3F3A, TP53, FGFR1, and CDKN2A deletion. Conclusion KIAA1549–BRAF was seen in higher frequency than BRAFV600E or other genetic aberrations in pediatric spinal LGGs and experienced lower death rates compared to KIAA1549–BRAF negative patients, although this was not statistically significant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,187
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle