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Enregistrement W3080555681 · doi:10.1101/2020.08.19.20178368

Inhaled corticosteroids downregulate SARS-CoV-2-related gene expression in COPD: results from a RCT

2020· preprint· en· W3080555681 sur OpenAlexaff
Stephen Milne, Xuan Li, Chen Xi Yang, Ana I. Hernández Cordero, Fernando Sergio Leitão Filho, Cheng Wei Tony Yang, Tawimas Shaipanich, Stephan F. van Eeden, Janice M. Leung, Stephen Lam, Don D. Sin

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensProvidence Health CareSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesAstraZeneca
Mots-clésFormoterolCOPDBudesonideMedicineFluticasoneFluticasone propionateRandomized controlled trialFormoterol FumarateImmunologyInternal medicinePharmacologyCorticosteroid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rationale Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a risk factor for severe COVID-19. Inhaled corticosteroids (ICS) are commonly prescribed for the prevention of acute exacerbations in people with COPD, but their use is associated with increased risk of respiratory infections. The effects of ICS on SARS-CoV-2 susceptibility or COVID-19 severity are currently unknown. Objectives To determine the effects of ICS treatment on the bronchial epithelial cell expression of key SARS-CoV-2-related genes in volunteers with COPD. Methods We performed a randomized, open-label, parallel treatment trial of 12 weeks treatment with ICS in combination with long-acting beta-agonist (formoterol/budesonide 12/400 µg twice daily or salmeterol/fluticasone propionate 25/250 µg twice daily), or treatment with LABA only (formoterol 12 µg twice daily), in volunteers with mild to very severe COPD. We obtained bronchial epithelial cell samples via bronchoscopy before and after treatment, and determined transcriptome-wide gene expression by RNA sequencing. Main Results 63 volunteers were randomized to receive treatment. Compared to formoterol alone, formoterol/budesonide treatment decreased the expression of the SARS-CoV-2 receptor gene ACE2 and the host cell protease gene ADAM17 . These genes were highly co-expressed with innate immune response genes, particularly those of the type I interferon and anti-viral response pathways, which also tended to decrease following ICS treatment. Conclusions This is the first randomized controlled trial to show that ICS affect the expression of key SARS-CoV-2-related genes in COPD. Their relation to important anti-viral response genes may have critical implications for SARS-CoV-2 susceptibility or COVID-19 severity in this vulnerable population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Essai randomisé · Signal consensuel: Essai randomisé
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeEssai randomisé
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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