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Enregistrement W3081164002 · doi:10.1165/rcmb.2020-0285le

Azithromycin Downregulates Gene Expression of IL-1β and Pathways Involving TMPRSS2 and TMPRSS11D Required by SARS-CoV-2

2020· letter· en· W3081164002 sur OpenAlexaff
Axel E. Renteria, Léandra Mfuna Endam, Damien Adam, Ali Filali‐Mouhim, Anastasios Maniakas, Simon Rousseau, Emmanuelle Brochiero, Stefania Gallo, Martin Desrosiers

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology · 2020
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug-Induced Adverse Reactions
Établissements canadiensMcGill University Health CentreCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAzithromycinBiologyInflammationGeneTMPRSS2Downregulation and upregulationGene expressionGene expression profilingMicroarray analysis techniquesCancer researchImmunologyMedicineGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background TMPRSS2, ACE2 and TMPRSS11D are genes coding for proteins necessary for SARS-CoV-2 activation, infection and transmission. Once SARS-CoV-2 enters the host cell, it leads to an exaggerated inflammatory state of the lungs mediated by overexpressed TNF-, IL-6, and IL-1β. We assessed azithromycin's effect on the aforementioned genes and their associated pathways to evaluate its potential use as a possible treatment. Objective Confirm the role azithromycin may play in the regulation of pathways and genes involved in inflammation and SARS-CoV-2 activation and cell-to-cell transmission. Methods Primary airway nasal epithelial cells collected from nasal biopsies of three patients with chronic rhinosinusitis (CRS) were primary cultured and treated or not with 10µg of azithromycin. RNA was extracted from these samples and analyzed using a microarray chip. Differential gene expression profiles and gene set enrichment analysis (GSEA) were obtained between both groups. Results Cell cultures treated with 10µg of azithromycin significantly downregulated receptor-mediated endocytosis canonical pathways involving TMPRSS2 and TMPRSS11D genes. Downregulated inflammation-associated genes included IL-1β and NDST1. Interestingly, numerous genes in the cholesterol biosynthesis pathway were significantly upregulated as part of a potential process named drug-induced phospholipidosis (DLP). Conclusions This proof of concept demonstrates azithromycin downregulates pathways involving serine proteases TMPRSS2 and TMPRSS11D required for SARS-CoV-2 activation and its cell-to-cell transmission while downregulating pro-inflammatory cytokine IL-1β, NDST-1 and their associated pathways. This may help reduce the characteristic excessive respiratory epithelial inflammation, key feature of SARS-CoV-2 infection. Finally, azithromycin may also decrease available cholesterol in lipid rafts which may hinder SARS-CoV-2 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,279
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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